Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
GCC1Q96CN9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GCC1Q96CN9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GCC1Q96CN9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GCC1Q96CN9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GCC1Q96CN9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GCC1Q96CN9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GCC1Q96CN9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GCC1Q96CN9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GCC1Q96CN9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GCC1Q96CN9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GCC1Q96CN9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
GCC1Q96CN9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GCC1Q96CN9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GCC1Q96CN9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GCC1Q96CN9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GCC1Q96CN9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GCC1Q96CN9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GCC1Q96CN9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GCC1Q96CN9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GCC1Q96CN9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GCC1Q96CN9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GCC1Q96CN9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GCC1Q96CN9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GCC1Q96CN9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GCC1Q96CN9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GCC1Q96CN9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
GCC1Q96CN9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GCC1Q96CN9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GCC1Q96CN9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GCC1Q96CN9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GCC1Q96CN9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
GCC1Q96CN9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GCC1Q96CN9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GCC1Q96CN9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GCC1Q96CN9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GCC1Q96CN9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GCC1Q96CN9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GCC1Q96CN9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GCC1Q96CN9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GCC1Q96CN9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GCC1Q96CN9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GCC1Q96CN9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GCC1Q96CN9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GCC1Q96CN9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GCC1Q96CN9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GCC1Q96CN9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GCC1Q96CN9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GCC1Q96CN9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GCC1Q96CN9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GCC1Q96CN9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GCC1Q96CN9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GCC1Q96CN9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GCC1Q96CN9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GCC1Q96CN9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
GCC1Q96CN9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GCC1Q96CN9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GCC1Q96CN9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GCC1Q96CN9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GCC1Q96CN9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GCC1Q96CN9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GCC1Q96CN9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GCC1Q96CN9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GCC1Q96CN9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GCC1Q96CN9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GCC1Q96CN9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
GCC1Q96CN9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GCC1Q96CN9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GCC1Q96CN9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GCC1Q96CN9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GCC1Q96CN9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GCC1Q96CN9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GCC1Q96CN9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GCC1Q96CN9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GCC1Q96CN9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GCC1Q96CN9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GCC1Q96CN9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GCC1Q96CN9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GCC1Q96CN9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GCC1Q96CN9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GCC1Q96CN9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GCC1Q96CN9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GCC1Q96CN9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GCC1Q96CN9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GCC1Q96CN9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GCC1Q96CN9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GCC1Q96CN9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GCC1Q96CN9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GCC1Q96CN9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GCC1Q96CN9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GCC1Q96CN9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GCC1Q96CN9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GCC1Q96CN9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GCC1Q96CN9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GCC1Q96CN9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GCC1Q96CN9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GCC1Q96CN9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GCC1Q96CN9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GCC1Q96CN9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GCC1Q96CN9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms