Protein–RNA interactions for Protein: Q96A99

PTX4, Pentraxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4Q96A99 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTX4Q96A99 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTX4Q96A99 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTX4Q96A99 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTX4Q96A99 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTX4Q96A99 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTX4Q96A99 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTX4Q96A99 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTX4Q96A99 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTX4Q96A99 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTX4Q96A99 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTX4Q96A99 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTX4Q96A99 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTX4Q96A99 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTX4Q96A99 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTX4Q96A99 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTX4Q96A99 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTX4Q96A99 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTX4Q96A99 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTX4Q96A99 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTX4Q96A99 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTX4Q96A99 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTX4Q96A99 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTX4Q96A99 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTX4Q96A99 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTX4Q96A99 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PTX4Q96A99 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTX4Q96A99 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTX4Q96A99 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTX4Q96A99 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTX4Q96A99 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTX4Q96A99 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTX4Q96A99 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTX4Q96A99 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTX4Q96A99 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTX4Q96A99 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTX4Q96A99 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTX4Q96A99 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTX4Q96A99 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTX4Q96A99 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTX4Q96A99 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTX4Q96A99 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTX4Q96A99 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTX4Q96A99 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTX4Q96A99 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTX4Q96A99 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTX4Q96A99 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTX4Q96A99 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTX4Q96A99 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTX4Q96A99 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTX4Q96A99 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTX4Q96A99 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTX4Q96A99 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTX4Q96A99 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTX4Q96A99 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTX4Q96A99 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTX4Q96A99 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTX4Q96A99 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTX4Q96A99 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTX4Q96A99 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTX4Q96A99 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTX4Q96A99 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTX4Q96A99 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTX4Q96A99 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTX4Q96A99 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTX4Q96A99 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTX4Q96A99 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTX4Q96A99 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTX4Q96A99 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTX4Q96A99 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTX4Q96A99 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTX4Q96A99 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTX4Q96A99 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTX4Q96A99 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTX4Q96A99 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTX4Q96A99 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTX4Q96A99 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTX4Q96A99 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTX4Q96A99 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTX4Q96A99 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTX4Q96A99 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTX4Q96A99 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTX4Q96A99 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTX4Q96A99 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTX4Q96A99 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTX4Q96A99 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTX4Q96A99 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTX4Q96A99 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTX4Q96A99 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTX4Q96A99 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTX4Q96A99 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTX4Q96A99 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTX4Q96A99 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTX4Q96A99 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTX4Q96A99 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTX4Q96A99 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTX4Q96A99 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTX4Q96A99 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTX4Q96A99 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTX4Q96A99 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms