Protein–RNA interactions for Protein: Q96A99

PTX4, Pentraxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4Q96A99 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTX4Q96A99 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTX4Q96A99 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTX4Q96A99 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTX4Q96A99 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTX4Q96A99 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PTX4Q96A99 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTX4Q96A99 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTX4Q96A99 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTX4Q96A99 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTX4Q96A99 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTX4Q96A99 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTX4Q96A99 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTX4Q96A99 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTX4Q96A99 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTX4Q96A99 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTX4Q96A99 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTX4Q96A99 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTX4Q96A99 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTX4Q96A99 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTX4Q96A99 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTX4Q96A99 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTX4Q96A99 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTX4Q96A99 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTX4Q96A99 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTX4Q96A99 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTX4Q96A99 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTX4Q96A99 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTX4Q96A99 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTX4Q96A99 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTX4Q96A99 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTX4Q96A99 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTX4Q96A99 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTX4Q96A99 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTX4Q96A99 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTX4Q96A99 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTX4Q96A99 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTX4Q96A99 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTX4Q96A99 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTX4Q96A99 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTX4Q96A99 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTX4Q96A99 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTX4Q96A99 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTX4Q96A99 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTX4Q96A99 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTX4Q96A99 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTX4Q96A99 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTX4Q96A99 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTX4Q96A99 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTX4Q96A99 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTX4Q96A99 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTX4Q96A99 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTX4Q96A99 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTX4Q96A99 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTX4Q96A99 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTX4Q96A99 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTX4Q96A99 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTX4Q96A99 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTX4Q96A99 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTX4Q96A99 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTX4Q96A99 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTX4Q96A99 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTX4Q96A99 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTX4Q96A99 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTX4Q96A99 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTX4Q96A99 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTX4Q96A99 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTX4Q96A99 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTX4Q96A99 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTX4Q96A99 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTX4Q96A99 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTX4Q96A99 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTX4Q96A99 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTX4Q96A99 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTX4Q96A99 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTX4Q96A99 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTX4Q96A99 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTX4Q96A99 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTX4Q96A99 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTX4Q96A99 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTX4Q96A99 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTX4Q96A99 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTX4Q96A99 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTX4Q96A99 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTX4Q96A99 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTX4Q96A99 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTX4Q96A99 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTX4Q96A99 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTX4Q96A99 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTX4Q96A99 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTX4Q96A99 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTX4Q96A99 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTX4Q96A99 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTX4Q96A99 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTX4Q96A99 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTX4Q96A99 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTX4Q96A99 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTX4Q96A99 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTX4Q96A99 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTX4Q96A99 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms