Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNX21Q969T3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNX21Q969T3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SNX21Q969T3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SNX21Q969T3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SNX21Q969T3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SNX21Q969T3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SNX21Q969T3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SNX21Q969T3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SNX21Q969T3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SNX21Q969T3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SNX21Q969T3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SNX21Q969T3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SNX21Q969T3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SNX21Q969T3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SNX21Q969T3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SNX21Q969T3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SNX21Q969T3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SNX21Q969T3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SNX21Q969T3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SNX21Q969T3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SNX21Q969T3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SNX21Q969T3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SNX21Q969T3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SNX21Q969T3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SNX21Q969T3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SNX21Q969T3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SNX21Q969T3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SNX21Q969T3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SNX21Q969T3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SNX21Q969T3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SNX21Q969T3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SNX21Q969T3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SNX21Q969T3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SNX21Q969T3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SNX21Q969T3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SNX21Q969T3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SNX21Q969T3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SNX21Q969T3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SNX21Q969T3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SNX21Q969T3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SNX21Q969T3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SNX21Q969T3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SNX21Q969T3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SNX21Q969T3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SNX21Q969T3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SNX21Q969T3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SNX21Q969T3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SNX21Q969T3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SNX21Q969T3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SNX21Q969T3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SNX21Q969T3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SNX21Q969T3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SNX21Q969T3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SNX21Q969T3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
SNX21Q969T3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SNX21Q969T3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SNX21Q969T3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SNX21Q969T3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SNX21Q969T3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SNX21Q969T3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SNX21Q969T3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SNX21Q969T3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SNX21Q969T3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
SNX21Q969T3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNX21Q969T3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNX21Q969T3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SNX21Q969T3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SNX21Q969T3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SNX21Q969T3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SNX21Q969T3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SNX21Q969T3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SNX21Q969T3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SNX21Q969T3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SNX21Q969T3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SNX21Q969T3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SNX21Q969T3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SNX21Q969T3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SNX21Q969T3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SNX21Q969T3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SNX21Q969T3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SNX21Q969T3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SNX21Q969T3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SNX21Q969T3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SNX21Q969T3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SNX21Q969T3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SNX21Q969T3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SNX21Q969T3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SNX21Q969T3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SNX21Q969T3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SNX21Q969T3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SNX21Q969T3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SNX21Q969T3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SNX21Q969T3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SNX21Q969T3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SNX21Q969T3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SNX21Q969T3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SNX21Q969T3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SNX21Q969T3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SNX21Q969T3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms