Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRN2Q92932 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRN2Q92932 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRN2Q92932 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRN2Q92932 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRN2Q92932 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRN2Q92932 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRN2Q92932 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRN2Q92932 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRN2Q92932 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRN2Q92932 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRN2Q92932 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRN2Q92932 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRN2Q92932 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRN2Q92932 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRN2Q92932 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRN2Q92932 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRN2Q92932 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRN2Q92932 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRN2Q92932 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRN2Q92932 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRN2Q92932 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRN2Q92932 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRN2Q92932 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRN2Q92932 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRN2Q92932 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRN2Q92932 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRN2Q92932 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRN2Q92932 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRN2Q92932 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRN2Q92932 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRN2Q92932 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRN2Q92932 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRN2Q92932 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRN2Q92932 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRN2Q92932 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRN2Q92932 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRN2Q92932 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRN2Q92932 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRN2Q92932 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRN2Q92932 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRN2Q92932 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRN2Q92932 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRN2Q92932 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRN2Q92932 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRN2Q92932 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRN2Q92932 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRN2Q92932 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRN2Q92932 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRN2Q92932 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRN2Q92932 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRN2Q92932 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRN2Q92932 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRN2Q92932 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRN2Q92932 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRN2Q92932 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRN2Q92932 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRN2Q92932 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRN2Q92932 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRN2Q92932 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRN2Q92932 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRN2Q92932 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRN2Q92932 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRN2Q92932 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRN2Q92932 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRN2Q92932 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRN2Q92932 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRN2Q92932 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRN2Q92932 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRN2Q92932 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRN2Q92932 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRN2Q92932 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRN2Q92932 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRN2Q92932 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRN2Q92932 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRN2Q92932 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRN2Q92932 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRN2Q92932 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRN2Q92932 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRN2Q92932 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRN2Q92932 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRN2Q92932 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRN2Q92932 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRN2Q92932 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRN2Q92932 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRN2Q92932 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRN2Q92932 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRN2Q92932 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRN2Q92932 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRN2Q92932 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRN2Q92932 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms