Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSMEM1Q8WWF3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSMEM1Q8WWF3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SSMEM1Q8WWF3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSMEM1Q8WWF3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSMEM1Q8WWF3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSMEM1Q8WWF3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSMEM1Q8WWF3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSMEM1Q8WWF3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SSMEM1Q8WWF3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSMEM1Q8WWF3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSMEM1Q8WWF3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSMEM1Q8WWF3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSMEM1Q8WWF3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSMEM1Q8WWF3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSMEM1Q8WWF3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSMEM1Q8WWF3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSMEM1Q8WWF3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSMEM1Q8WWF3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSMEM1Q8WWF3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSMEM1Q8WWF3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSMEM1Q8WWF3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSMEM1Q8WWF3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSMEM1Q8WWF3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSMEM1Q8WWF3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SSMEM1Q8WWF3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSMEM1Q8WWF3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSMEM1Q8WWF3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSMEM1Q8WWF3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSMEM1Q8WWF3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSMEM1Q8WWF3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSMEM1Q8WWF3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSMEM1Q8WWF3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSMEM1Q8WWF3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSMEM1Q8WWF3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSMEM1Q8WWF3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSMEM1Q8WWF3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSMEM1Q8WWF3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSMEM1Q8WWF3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSMEM1Q8WWF3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSMEM1Q8WWF3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSMEM1Q8WWF3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSMEM1Q8WWF3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSMEM1Q8WWF3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSMEM1Q8WWF3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSMEM1Q8WWF3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSMEM1Q8WWF3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSMEM1Q8WWF3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSMEM1Q8WWF3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSMEM1Q8WWF3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSMEM1Q8WWF3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSMEM1Q8WWF3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSMEM1Q8WWF3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSMEM1Q8WWF3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSMEM1Q8WWF3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSMEM1Q8WWF3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSMEM1Q8WWF3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSMEM1Q8WWF3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSMEM1Q8WWF3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSMEM1Q8WWF3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSMEM1Q8WWF3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSMEM1Q8WWF3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSMEM1Q8WWF3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSMEM1Q8WWF3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSMEM1Q8WWF3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSMEM1Q8WWF3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms