Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNPRQ8TBG9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNPRQ8TBG9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNPRQ8TBG9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNPRQ8TBG9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNPRQ8TBG9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNPRQ8TBG9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPRQ8TBG9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPRQ8TBG9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPRQ8TBG9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPRQ8TBG9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPRQ8TBG9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPRQ8TBG9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNPRQ8TBG9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNPRQ8TBG9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPRQ8TBG9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPRQ8TBG9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNPRQ8TBG9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPRQ8TBG9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPRQ8TBG9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPRQ8TBG9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPRQ8TBG9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNPRQ8TBG9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNPRQ8TBG9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPRQ8TBG9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPRQ8TBG9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPRQ8TBG9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPRQ8TBG9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNPRQ8TBG9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNPRQ8TBG9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPRQ8TBG9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNPRQ8TBG9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNPRQ8TBG9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPRQ8TBG9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPRQ8TBG9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPRQ8TBG9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPRQ8TBG9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPRQ8TBG9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPRQ8TBG9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPRQ8TBG9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPRQ8TBG9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPRQ8TBG9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNPRQ8TBG9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPRQ8TBG9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPRQ8TBG9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPRQ8TBG9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNPRQ8TBG9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNPRQ8TBG9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPRQ8TBG9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPRQ8TBG9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPRQ8TBG9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPRQ8TBG9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNPRQ8TBG9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNPRQ8TBG9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNPRQ8TBG9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNPRQ8TBG9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPRQ8TBG9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPRQ8TBG9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPRQ8TBG9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPRQ8TBG9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPRQ8TBG9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPRQ8TBG9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPRQ8TBG9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPRQ8TBG9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPRQ8TBG9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPRQ8TBG9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPRQ8TBG9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPRQ8TBG9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPRQ8TBG9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNPRQ8TBG9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNPRQ8TBG9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPRQ8TBG9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPRQ8TBG9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPRQ8TBG9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPRQ8TBG9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPRQ8TBG9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPRQ8TBG9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPRQ8TBG9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPRQ8TBG9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPRQ8TBG9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPRQ8TBG9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPRQ8TBG9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPRQ8TBG9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPRQ8TBG9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPRQ8TBG9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPRQ8TBG9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPRQ8TBG9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPRQ8TBG9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPRQ8TBG9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPRQ8TBG9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPRQ8TBG9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPRQ8TBG9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPRQ8TBG9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPRQ8TBG9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPRQ8TBG9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPRQ8TBG9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPRQ8TBG9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPRQ8TBG9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPRQ8TBG9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPRQ8TBG9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms