Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG57

ELOA3, Elongin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOA3Q8NG57 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELOA3Q8NG57 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELOA3Q8NG57 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELOA3Q8NG57 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELOA3Q8NG57 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELOA3Q8NG57 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELOA3Q8NG57 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELOA3Q8NG57 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ELOA3Q8NG57 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ELOA3Q8NG57 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ELOA3Q8NG57 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ELOA3Q8NG57 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ELOA3Q8NG57 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ELOA3Q8NG57 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ELOA3Q8NG57 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ELOA3Q8NG57 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ELOA3Q8NG57 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELOA3Q8NG57 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELOA3Q8NG57 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELOA3Q8NG57 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ELOA3Q8NG57 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ELOA3Q8NG57 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ELOA3Q8NG57 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELOA3Q8NG57 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELOA3Q8NG57 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELOA3Q8NG57 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELOA3Q8NG57 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELOA3Q8NG57 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELOA3Q8NG57 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELOA3Q8NG57 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELOA3Q8NG57 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELOA3Q8NG57 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELOA3Q8NG57 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELOA3Q8NG57 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ELOA3Q8NG57 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ELOA3Q8NG57 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ELOA3Q8NG57 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ELOA3Q8NG57 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ELOA3Q8NG57 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ELOA3Q8NG57 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ELOA3Q8NG57 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ELOA3Q8NG57 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ELOA3Q8NG57 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELOA3Q8NG57 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELOA3Q8NG57 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELOA3Q8NG57 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELOA3Q8NG57 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ELOA3Q8NG57 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ELOA3Q8NG57 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ELOA3Q8NG57 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ELOA3Q8NG57 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ELOA3Q8NG57 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ELOA3Q8NG57 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ELOA3Q8NG57 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ELOA3Q8NG57 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ELOA3Q8NG57 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ELOA3Q8NG57 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ELOA3Q8NG57 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ELOA3Q8NG57 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ELOA3Q8NG57 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ELOA3Q8NG57 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ELOA3Q8NG57 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ELOA3Q8NG57 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ELOA3Q8NG57 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ELOA3Q8NG57 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ELOA3Q8NG57 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ELOA3Q8NG57 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ELOA3Q8NG57 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ELOA3Q8NG57 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ELOA3Q8NG57 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ELOA3Q8NG57 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ELOA3Q8NG57 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ELOA3Q8NG57 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ELOA3Q8NG57 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELOA3Q8NG57 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELOA3Q8NG57 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELOA3Q8NG57 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELOA3Q8NG57 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms