Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
VPS8Q8N3P4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC44.13■■■■■ 4.65
VPS8Q8N3P4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
VPS8Q8N3P4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
VPS8Q8N3P4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
VPS8Q8N3P4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
VPS8Q8N3P4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
VPS8Q8N3P4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.64
VPS8Q8N3P4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
VPS8Q8N3P4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
VPS8Q8N3P4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
VPS8Q8N3P4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
VPS8Q8N3P4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
VPS8Q8N3P4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
VPS8Q8N3P4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
VPS8Q8N3P4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
VPS8Q8N3P4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
VPS8Q8N3P4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
VPS8Q8N3P4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
VPS8Q8N3P4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
VPS8Q8N3P4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC43.89■■■■■ 4.62
VPS8Q8N3P4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
VPS8Q8N3P4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
VPS8Q8N3P4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
VPS8Q8N3P4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
VPS8Q8N3P4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
VPS8Q8N3P4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
VPS8Q8N3P4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
VPS8Q8N3P4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
VPS8Q8N3P4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
VPS8Q8N3P4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
VPS8Q8N3P4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
VPS8Q8N3P4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
VPS8Q8N3P4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
VPS8Q8N3P4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
VPS8Q8N3P4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
VPS8Q8N3P4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
VPS8Q8N3P4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
VPS8Q8N3P4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
VPS8Q8N3P4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
VPS8Q8N3P4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
VPS8Q8N3P4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
VPS8Q8N3P4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
VPS8Q8N3P4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
VPS8Q8N3P4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
VPS8Q8N3P4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
VPS8Q8N3P4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
VPS8Q8N3P4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC43.58■■■■■ 4.57
VPS8Q8N3P4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
VPS8Q8N3P4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC43.57■■■■■ 4.57
VPS8Q8N3P4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
VPS8Q8N3P4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
VPS8Q8N3P4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
VPS8Q8N3P4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
VPS8Q8N3P4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
VPS8Q8N3P4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
VPS8Q8N3P4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
VPS8Q8N3P4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
VPS8Q8N3P4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
VPS8Q8N3P4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
VPS8Q8N3P4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
VPS8Q8N3P4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
VPS8Q8N3P4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
VPS8Q8N3P4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
VPS8Q8N3P4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
VPS8Q8N3P4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
VPS8Q8N3P4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
VPS8Q8N3P4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
VPS8Q8N3P4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
VPS8Q8N3P4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
VPS8Q8N3P4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
VPS8Q8N3P4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
VPS8Q8N3P4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
VPS8Q8N3P4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
VPS8Q8N3P4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
VPS8Q8N3P4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
VPS8Q8N3P4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
VPS8Q8N3P4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
VPS8Q8N3P4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
VPS8Q8N3P4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
VPS8Q8N3P4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
VPS8Q8N3P4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
VPS8Q8N3P4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
VPS8Q8N3P4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
VPS8Q8N3P4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
VPS8Q8N3P4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
VPS8Q8N3P4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
VPS8Q8N3P4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
VPS8Q8N3P4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
VPS8Q8N3P4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
VPS8Q8N3P4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
VPS8Q8N3P4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
VPS8Q8N3P4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
VPS8Q8N3P4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
VPS8Q8N3P4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
VPS8Q8N3P4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
VPS8Q8N3P4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
VPS8Q8N3P4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
VPS8Q8N3P4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
VPS8Q8N3P4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms