Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L2

R3HCC1L, Coiled-coil domain-containing protein R3HCC1L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1LQ7Z5L2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HCC1LQ7Z5L2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HCC1LQ7Z5L2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HCC1LQ7Z5L2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HCC1LQ7Z5L2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HCC1LQ7Z5L2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HCC1LQ7Z5L2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HCC1LQ7Z5L2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HCC1LQ7Z5L2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HCC1LQ7Z5L2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HCC1LQ7Z5L2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HCC1LQ7Z5L2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HCC1LQ7Z5L2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HCC1LQ7Z5L2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HCC1LQ7Z5L2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HCC1LQ7Z5L2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HCC1LQ7Z5L2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HCC1LQ7Z5L2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
R3HCC1LQ7Z5L2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
R3HCC1LQ7Z5L2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
R3HCC1LQ7Z5L2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
R3HCC1LQ7Z5L2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
R3HCC1LQ7Z5L2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
R3HCC1LQ7Z5L2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
R3HCC1LQ7Z5L2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
R3HCC1LQ7Z5L2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
R3HCC1LQ7Z5L2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
R3HCC1LQ7Z5L2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HCC1LQ7Z5L2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
R3HCC1LQ7Z5L2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HCC1LQ7Z5L2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HCC1LQ7Z5L2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HCC1LQ7Z5L2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HCC1LQ7Z5L2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
R3HCC1LQ7Z5L2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
R3HCC1LQ7Z5L2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
R3HCC1LQ7Z5L2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
R3HCC1LQ7Z5L2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HCC1LQ7Z5L2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HCC1LQ7Z5L2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HCC1LQ7Z5L2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HCC1LQ7Z5L2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HCC1LQ7Z5L2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HCC1LQ7Z5L2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HCC1LQ7Z5L2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HCC1LQ7Z5L2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
R3HCC1LQ7Z5L2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HCC1LQ7Z5L2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HCC1LQ7Z5L2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HCC1LQ7Z5L2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HCC1LQ7Z5L2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HCC1LQ7Z5L2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1LQ7Z5L2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HCC1LQ7Z5L2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HCC1LQ7Z5L2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HCC1LQ7Z5L2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HCC1LQ7Z5L2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HCC1LQ7Z5L2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HCC1LQ7Z5L2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HCC1LQ7Z5L2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HCC1LQ7Z5L2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HCC1LQ7Z5L2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HCC1LQ7Z5L2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
R3HCC1LQ7Z5L2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
R3HCC1LQ7Z5L2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
R3HCC1LQ7Z5L2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
R3HCC1LQ7Z5L2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HCC1LQ7Z5L2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HCC1LQ7Z5L2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
R3HCC1LQ7Z5L2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
R3HCC1LQ7Z5L2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HCC1LQ7Z5L2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HCC1LQ7Z5L2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HCC1LQ7Z5L2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HCC1LQ7Z5L2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HCC1LQ7Z5L2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HCC1LQ7Z5L2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
R3HCC1LQ7Z5L2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
R3HCC1LQ7Z5L2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HCC1LQ7Z5L2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HCC1LQ7Z5L2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms