Protein–RNA interactions for Protein: Q7L273

KCTD9, BTB/POZ domain-containing protein KCTD9, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD9Q7L273 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD9Q7L273 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD9Q7L273 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD9Q7L273 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCTD9Q7L273 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD9Q7L273 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD9Q7L273 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD9Q7L273 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD9Q7L273 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD9Q7L273 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD9Q7L273 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD9Q7L273 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD9Q7L273 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD9Q7L273 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD9Q7L273 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD9Q7L273 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD9Q7L273 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD9Q7L273 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD9Q7L273 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD9Q7L273 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD9Q7L273 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD9Q7L273 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD9Q7L273 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD9Q7L273 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD9Q7L273 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD9Q7L273 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD9Q7L273 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD9Q7L273 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD9Q7L273 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD9Q7L273 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD9Q7L273 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD9Q7L273 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD9Q7L273 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD9Q7L273 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD9Q7L273 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD9Q7L273 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD9Q7L273 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD9Q7L273 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD9Q7L273 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD9Q7L273 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD9Q7L273 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD9Q7L273 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD9Q7L273 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD9Q7L273 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCTD9Q7L273 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD9Q7L273 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD9Q7L273 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD9Q7L273 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD9Q7L273 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD9Q7L273 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD9Q7L273 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD9Q7L273 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD9Q7L273 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD9Q7L273 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD9Q7L273 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD9Q7L273 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD9Q7L273 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD9Q7L273 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD9Q7L273 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD9Q7L273 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD9Q7L273 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD9Q7L273 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD9Q7L273 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD9Q7L273 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD9Q7L273 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD9Q7L273 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD9Q7L273 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD9Q7L273 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD9Q7L273 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD9Q7L273 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD9Q7L273 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD9Q7L273 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD9Q7L273 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD9Q7L273 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD9Q7L273 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD9Q7L273 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD9Q7L273 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD9Q7L273 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD9Q7L273 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCTD9Q7L273 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCTD9Q7L273 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD9Q7L273 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD9Q7L273 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD9Q7L273 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD9Q7L273 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.8 ms