Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFX8Q6ZV50 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFX8Q6ZV50 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RFX8Q6ZV50 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RFX8Q6ZV50 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RFX8Q6ZV50 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RFX8Q6ZV50 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RFX8Q6ZV50 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RFX8Q6ZV50 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFX8Q6ZV50 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFX8Q6ZV50 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RFX8Q6ZV50 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFX8Q6ZV50 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFX8Q6ZV50 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFX8Q6ZV50 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFX8Q6ZV50 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFX8Q6ZV50 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RFX8Q6ZV50 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFX8Q6ZV50 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFX8Q6ZV50 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFX8Q6ZV50 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFX8Q6ZV50 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFX8Q6ZV50 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFX8Q6ZV50 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFX8Q6ZV50 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFX8Q6ZV50 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFX8Q6ZV50 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFX8Q6ZV50 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RFX8Q6ZV50 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RFX8Q6ZV50 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFX8Q6ZV50 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFX8Q6ZV50 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFX8Q6ZV50 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFX8Q6ZV50 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFX8Q6ZV50 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFX8Q6ZV50 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX8Q6ZV50 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX8Q6ZV50 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFX8Q6ZV50 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFX8Q6ZV50 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFX8Q6ZV50 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RFX8Q6ZV50 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFX8Q6ZV50 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFX8Q6ZV50 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX8Q6ZV50 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX8Q6ZV50 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX8Q6ZV50 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX8Q6ZV50 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFX8Q6ZV50 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFX8Q6ZV50 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX8Q6ZV50 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX8Q6ZV50 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX8Q6ZV50 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RFX8Q6ZV50 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RFX8Q6ZV50 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RFX8Q6ZV50 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX8Q6ZV50 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX8Q6ZV50 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX8Q6ZV50 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX8Q6ZV50 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX8Q6ZV50 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX8Q6ZV50 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX8Q6ZV50 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX8Q6ZV50 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX8Q6ZV50 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX8Q6ZV50 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX8Q6ZV50 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX8Q6ZV50 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX8Q6ZV50 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RFX8Q6ZV50 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX8Q6ZV50 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX8Q6ZV50 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX8Q6ZV50 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX8Q6ZV50 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFX8Q6ZV50 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFX8Q6ZV50 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX8Q6ZV50 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX8Q6ZV50 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFX8Q6ZV50 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFX8Q6ZV50 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFX8Q6ZV50 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFX8Q6ZV50 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFX8Q6ZV50 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RFX8Q6ZV50 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RFX8Q6ZV50 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RFX8Q6ZV50 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFX8Q6ZV50 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFX8Q6ZV50 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RFX8Q6ZV50 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RFX8Q6ZV50 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RFX8Q6ZV50 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RFX8Q6ZV50 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RFX8Q6ZV50 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RFX8Q6ZV50 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RFX8Q6ZV50 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RFX8Q6ZV50 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RFX8Q6ZV50 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RFX8Q6ZV50 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RFX8Q6ZV50 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RFX8Q6ZV50 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms