Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPN12Q6ZSI9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN12Q6ZSI9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPN12Q6ZSI9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN12Q6ZSI9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN12Q6ZSI9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN12Q6ZSI9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN12Q6ZSI9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPN12Q6ZSI9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAPN12Q6ZSI9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPN12Q6ZSI9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN12Q6ZSI9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN12Q6ZSI9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN12Q6ZSI9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN12Q6ZSI9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN12Q6ZSI9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN12Q6ZSI9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN12Q6ZSI9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN12Q6ZSI9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN12Q6ZSI9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN12Q6ZSI9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN12Q6ZSI9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN12Q6ZSI9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN12Q6ZSI9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN12Q6ZSI9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN12Q6ZSI9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN12Q6ZSI9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN12Q6ZSI9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN12Q6ZSI9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CAPN12Q6ZSI9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN12Q6ZSI9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN12Q6ZSI9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN12Q6ZSI9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN12Q6ZSI9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN12Q6ZSI9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN12Q6ZSI9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN12Q6ZSI9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN12Q6ZSI9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN12Q6ZSI9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN12Q6ZSI9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN12Q6ZSI9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN12Q6ZSI9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN12Q6ZSI9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN12Q6ZSI9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAPN12Q6ZSI9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN12Q6ZSI9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN12Q6ZSI9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN12Q6ZSI9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN12Q6ZSI9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN12Q6ZSI9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN12Q6ZSI9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN12Q6ZSI9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN12Q6ZSI9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPN12Q6ZSI9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPN12Q6ZSI9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPN12Q6ZSI9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN12Q6ZSI9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN12Q6ZSI9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN12Q6ZSI9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN12Q6ZSI9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN12Q6ZSI9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN12Q6ZSI9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN12Q6ZSI9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN12Q6ZSI9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPN12Q6ZSI9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPN12Q6ZSI9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN12Q6ZSI9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN12Q6ZSI9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN12Q6ZSI9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN12Q6ZSI9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN12Q6ZSI9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN12Q6ZSI9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN12Q6ZSI9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN12Q6ZSI9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN12Q6ZSI9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN12Q6ZSI9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN12Q6ZSI9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN12Q6ZSI9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN12Q6ZSI9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN12Q6ZSI9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN12Q6ZSI9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN12Q6ZSI9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN12Q6ZSI9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN12Q6ZSI9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPN12Q6ZSI9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN12Q6ZSI9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN12Q6ZSI9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN12Q6ZSI9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN12Q6ZSI9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN12Q6ZSI9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN12Q6ZSI9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN12Q6ZSI9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN12Q6ZSI9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN12Q6ZSI9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAPN12Q6ZSI9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAPN12Q6ZSI9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAPN12Q6ZSI9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms