Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC73Q6ZRK6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC73Q6ZRK6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC73Q6ZRK6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC73Q6ZRK6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC73Q6ZRK6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC73Q6ZRK6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC73Q6ZRK6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC73Q6ZRK6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC73Q6ZRK6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC73Q6ZRK6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC73Q6ZRK6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC73Q6ZRK6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC73Q6ZRK6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC73Q6ZRK6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC73Q6ZRK6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC73Q6ZRK6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC73Q6ZRK6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC73Q6ZRK6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC73Q6ZRK6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC73Q6ZRK6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC73Q6ZRK6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC73Q6ZRK6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC73Q6ZRK6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC73Q6ZRK6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC73Q6ZRK6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC73Q6ZRK6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC73Q6ZRK6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC73Q6ZRK6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC73Q6ZRK6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC73Q6ZRK6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC73Q6ZRK6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC73Q6ZRK6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC73Q6ZRK6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC73Q6ZRK6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CCDC73Q6ZRK6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC73Q6ZRK6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC73Q6ZRK6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC73Q6ZRK6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC73Q6ZRK6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC73Q6ZRK6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC73Q6ZRK6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC73Q6ZRK6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC73Q6ZRK6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC73Q6ZRK6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC73Q6ZRK6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC73Q6ZRK6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC73Q6ZRK6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC73Q6ZRK6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC73Q6ZRK6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC73Q6ZRK6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC73Q6ZRK6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC73Q6ZRK6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC73Q6ZRK6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC73Q6ZRK6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC73Q6ZRK6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.61
CCDC73Q6ZRK6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC73Q6ZRK6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC73Q6ZRK6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC73Q6ZRK6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC73Q6ZRK6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC73Q6ZRK6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC73Q6ZRK6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC73Q6ZRK6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC73Q6ZRK6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC73Q6ZRK6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC73Q6ZRK6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC73Q6ZRK6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC73Q6ZRK6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC73Q6ZRK6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC73Q6ZRK6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC73Q6ZRK6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC73Q6ZRK6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC73Q6ZRK6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC73Q6ZRK6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC73Q6ZRK6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC73Q6ZRK6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC73Q6ZRK6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC73Q6ZRK6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC73Q6ZRK6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC73Q6ZRK6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC73Q6ZRK6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC73Q6ZRK6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC73Q6ZRK6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC73Q6ZRK6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC73Q6ZRK6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC73Q6ZRK6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC73Q6ZRK6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC73Q6ZRK6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC73Q6ZRK6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC73Q6ZRK6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC73Q6ZRK6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC73Q6ZRK6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC73Q6ZRK6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC73Q6ZRK6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC73Q6ZRK6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
CCDC73Q6ZRK6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC73Q6ZRK6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms