Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPTNQ6XPR3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPTNQ6XPR3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPTNQ6XPR3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPTNQ6XPR3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPTNQ6XPR3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPTNQ6XPR3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPTNQ6XPR3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPTNQ6XPR3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPTNQ6XPR3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPTNQ6XPR3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPTNQ6XPR3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPTNQ6XPR3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPTNQ6XPR3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPTNQ6XPR3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPTNQ6XPR3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RPTNQ6XPR3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPTNQ6XPR3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPTNQ6XPR3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPTNQ6XPR3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPTNQ6XPR3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPTNQ6XPR3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPTNQ6XPR3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPTNQ6XPR3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPTNQ6XPR3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPTNQ6XPR3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPTNQ6XPR3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPTNQ6XPR3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPTNQ6XPR3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPTNQ6XPR3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPTNQ6XPR3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPTNQ6XPR3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPTNQ6XPR3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPTNQ6XPR3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPTNQ6XPR3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPTNQ6XPR3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPTNQ6XPR3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPTNQ6XPR3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPTNQ6XPR3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPTNQ6XPR3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPTNQ6XPR3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPTNQ6XPR3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPTNQ6XPR3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPTNQ6XPR3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPTNQ6XPR3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPTNQ6XPR3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPTNQ6XPR3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPTNQ6XPR3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPTNQ6XPR3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPTNQ6XPR3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPTNQ6XPR3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPTNQ6XPR3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPTNQ6XPR3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPTNQ6XPR3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPTNQ6XPR3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPTNQ6XPR3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPTNQ6XPR3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPTNQ6XPR3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPTNQ6XPR3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPTNQ6XPR3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPTNQ6XPR3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPTNQ6XPR3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPTNQ6XPR3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPTNQ6XPR3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPTNQ6XPR3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPTNQ6XPR3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPTNQ6XPR3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RPTNQ6XPR3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPTNQ6XPR3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RPTNQ6XPR3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPTNQ6XPR3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPTNQ6XPR3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPTNQ6XPR3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPTNQ6XPR3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPTNQ6XPR3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPTNQ6XPR3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPTNQ6XPR3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPTNQ6XPR3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPTNQ6XPR3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPTNQ6XPR3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPTNQ6XPR3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPTNQ6XPR3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPTNQ6XPR3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms