Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PACS1Q6VY07 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PACS1Q6VY07 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PACS1Q6VY07 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PACS1Q6VY07 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PACS1Q6VY07 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PACS1Q6VY07 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PACS1Q6VY07 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PACS1Q6VY07 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PACS1Q6VY07 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PACS1Q6VY07 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PACS1Q6VY07 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PACS1Q6VY07 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PACS1Q6VY07 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PACS1Q6VY07 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PACS1Q6VY07 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PACS1Q6VY07 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PACS1Q6VY07 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PACS1Q6VY07 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PACS1Q6VY07 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PACS1Q6VY07 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PACS1Q6VY07 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PACS1Q6VY07 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PACS1Q6VY07 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PACS1Q6VY07 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PACS1Q6VY07 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PACS1Q6VY07 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PACS1Q6VY07 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PACS1Q6VY07 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PACS1Q6VY07 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PACS1Q6VY07 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PACS1Q6VY07 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PACS1Q6VY07 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PACS1Q6VY07 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PACS1Q6VY07 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PACS1Q6VY07 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PACS1Q6VY07 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PACS1Q6VY07 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PACS1Q6VY07 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PACS1Q6VY07 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PACS1Q6VY07 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PACS1Q6VY07 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PACS1Q6VY07 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PACS1Q6VY07 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PACS1Q6VY07 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PACS1Q6VY07 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PACS1Q6VY07 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PACS1Q6VY07 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PACS1Q6VY07 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PACS1Q6VY07 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PACS1Q6VY07 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PACS1Q6VY07 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PACS1Q6VY07 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PACS1Q6VY07 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PACS1Q6VY07 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PACS1Q6VY07 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PACS1Q6VY07 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PACS1Q6VY07 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PACS1Q6VY07 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PACS1Q6VY07 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PACS1Q6VY07 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PACS1Q6VY07 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PACS1Q6VY07 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PACS1Q6VY07 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PACS1Q6VY07 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PACS1Q6VY07 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PACS1Q6VY07 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PACS1Q6VY07 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PACS1Q6VY07 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PACS1Q6VY07 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PACS1Q6VY07 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PACS1Q6VY07 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PACS1Q6VY07 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PACS1Q6VY07 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PACS1Q6VY07 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PACS1Q6VY07 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PACS1Q6VY07 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PACS1Q6VY07 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PACS1Q6VY07 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PACS1Q6VY07 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PACS1Q6VY07 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PACS1Q6VY07 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PACS1Q6VY07 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PACS1Q6VY07 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PACS1Q6VY07 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PACS1Q6VY07 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PACS1Q6VY07 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PACS1Q6VY07 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PACS1Q6VY07 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PACS1Q6VY07 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PACS1Q6VY07 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PACS1Q6VY07 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PACS1Q6VY07 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PACS1Q6VY07 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PACS1Q6VY07 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PACS1Q6VY07 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PACS1Q6VY07 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PACS1Q6VY07 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PACS1Q6VY07 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PACS1Q6VY07 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms