Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI47

KCTD18, BTB/POZ domain-containing protein KCTD18, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD18Q6PI47 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD18Q6PI47 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD18Q6PI47 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCTD18Q6PI47 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCTD18Q6PI47 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD18Q6PI47 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD18Q6PI47 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD18Q6PI47 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD18Q6PI47 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD18Q6PI47 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD18Q6PI47 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD18Q6PI47 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD18Q6PI47 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD18Q6PI47 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD18Q6PI47 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD18Q6PI47 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD18Q6PI47 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD18Q6PI47 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD18Q6PI47 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCTD18Q6PI47 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD18Q6PI47 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD18Q6PI47 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD18Q6PI47 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD18Q6PI47 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD18Q6PI47 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD18Q6PI47 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD18Q6PI47 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD18Q6PI47 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD18Q6PI47 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD18Q6PI47 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD18Q6PI47 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD18Q6PI47 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD18Q6PI47 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD18Q6PI47 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD18Q6PI47 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD18Q6PI47 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD18Q6PI47 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCTD18Q6PI47 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD18Q6PI47 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD18Q6PI47 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD18Q6PI47 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD18Q6PI47 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD18Q6PI47 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD18Q6PI47 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD18Q6PI47 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD18Q6PI47 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCTD18Q6PI47 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCTD18Q6PI47 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD18Q6PI47 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD18Q6PI47 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD18Q6PI47 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD18Q6PI47 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD18Q6PI47 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD18Q6PI47 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCTD18Q6PI47 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCTD18Q6PI47 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCTD18Q6PI47 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCTD18Q6PI47 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCTD18Q6PI47 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD18Q6PI47 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD18Q6PI47 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCTD18Q6PI47 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD18Q6PI47 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD18Q6PI47 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD18Q6PI47 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms