Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LCN12Q6JVE5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCN12Q6JVE5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCN12Q6JVE5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCN12Q6JVE5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN12Q6JVE5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN12Q6JVE5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN12Q6JVE5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN12Q6JVE5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN12Q6JVE5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN12Q6JVE5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN12Q6JVE5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCN12Q6JVE5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCN12Q6JVE5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCN12Q6JVE5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCN12Q6JVE5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCN12Q6JVE5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCN12Q6JVE5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCN12Q6JVE5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCN12Q6JVE5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCN12Q6JVE5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCN12Q6JVE5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN12Q6JVE5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN12Q6JVE5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN12Q6JVE5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN12Q6JVE5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN12Q6JVE5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN12Q6JVE5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN12Q6JVE5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN12Q6JVE5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LCN12Q6JVE5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCN12Q6JVE5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCN12Q6JVE5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCN12Q6JVE5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LCN12Q6JVE5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LCN12Q6JVE5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCN12Q6JVE5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCN12Q6JVE5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCN12Q6JVE5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LCN12Q6JVE5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCN12Q6JVE5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN12Q6JVE5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN12Q6JVE5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN12Q6JVE5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN12Q6JVE5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN12Q6JVE5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN12Q6JVE5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN12Q6JVE5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN12Q6JVE5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCN12Q6JVE5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN12Q6JVE5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN12Q6JVE5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN12Q6JVE5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LCN12Q6JVE5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN12Q6JVE5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN12Q6JVE5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN12Q6JVE5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN12Q6JVE5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN12Q6JVE5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN12Q6JVE5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN12Q6JVE5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN12Q6JVE5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN12Q6JVE5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN12Q6JVE5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCN12Q6JVE5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCN12Q6JVE5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCN12Q6JVE5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LCN12Q6JVE5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCN12Q6JVE5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCN12Q6JVE5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCN12Q6JVE5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCN12Q6JVE5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCN12Q6JVE5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCN12Q6JVE5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCN12Q6JVE5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCN12Q6JVE5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCN12Q6JVE5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCN12Q6JVE5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCN12Q6JVE5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCN12Q6JVE5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCN12Q6JVE5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCN12Q6JVE5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LCN12Q6JVE5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms