Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM225Q6GV28 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM225Q6GV28 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM225Q6GV28 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM225Q6GV28 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM225Q6GV28 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM225Q6GV28 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM225Q6GV28 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM225Q6GV28 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM225Q6GV28 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM225Q6GV28 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM225Q6GV28 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM225Q6GV28 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM225Q6GV28 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM225Q6GV28 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM225Q6GV28 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM225Q6GV28 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM225Q6GV28 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM225Q6GV28 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM225Q6GV28 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM225Q6GV28 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM225Q6GV28 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM225Q6GV28 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM225Q6GV28 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM225Q6GV28 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM225Q6GV28 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM225Q6GV28 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM225Q6GV28 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM225Q6GV28 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM225Q6GV28 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM225Q6GV28 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM225Q6GV28 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM225Q6GV28 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM225Q6GV28 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM225Q6GV28 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM225Q6GV28 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM225Q6GV28 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM225Q6GV28 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM225Q6GV28 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM225Q6GV28 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM225Q6GV28 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM225Q6GV28 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM225Q6GV28 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM225Q6GV28 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM225Q6GV28 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM225Q6GV28 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM225Q6GV28 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM225Q6GV28 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM225Q6GV28 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM225Q6GV28 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM225Q6GV28 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM225Q6GV28 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM225Q6GV28 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM225Q6GV28 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM225Q6GV28 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM225Q6GV28 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM225Q6GV28 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM225Q6GV28 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM225Q6GV28 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM225Q6GV28 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM225Q6GV28 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM225Q6GV28 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM225Q6GV28 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM225Q6GV28 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM225Q6GV28 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM225Q6GV28 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM225Q6GV28 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM225Q6GV28 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM225Q6GV28 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM225Q6GV28 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM225Q6GV28 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM225Q6GV28 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM225Q6GV28 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM225Q6GV28 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM225Q6GV28 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM225Q6GV28 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM225Q6GV28 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM225Q6GV28 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM225Q6GV28 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM225Q6GV28 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM225Q6GV28 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM225Q6GV28 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM225Q6GV28 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM225Q6GV28 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms