Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZI3

TMEM268, Transmembrane protein 268, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM268Q5VZI3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM268Q5VZI3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM268Q5VZI3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM268Q5VZI3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM268Q5VZI3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM268Q5VZI3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM268Q5VZI3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM268Q5VZI3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM268Q5VZI3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM268Q5VZI3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM268Q5VZI3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM268Q5VZI3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM268Q5VZI3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM268Q5VZI3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM268Q5VZI3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM268Q5VZI3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM268Q5VZI3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM268Q5VZI3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM268Q5VZI3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM268Q5VZI3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM268Q5VZI3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM268Q5VZI3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM268Q5VZI3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM268Q5VZI3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM268Q5VZI3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM268Q5VZI3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM268Q5VZI3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM268Q5VZI3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM268Q5VZI3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM268Q5VZI3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM268Q5VZI3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM268Q5VZI3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM268Q5VZI3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM268Q5VZI3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM268Q5VZI3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM268Q5VZI3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM268Q5VZI3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM268Q5VZI3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM268Q5VZI3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM268Q5VZI3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM268Q5VZI3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM268Q5VZI3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM268Q5VZI3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM268Q5VZI3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM268Q5VZI3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM268Q5VZI3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM268Q5VZI3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM268Q5VZI3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM268Q5VZI3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM268Q5VZI3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM268Q5VZI3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM268Q5VZI3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM268Q5VZI3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM268Q5VZI3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM268Q5VZI3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM268Q5VZI3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM268Q5VZI3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM268Q5VZI3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM268Q5VZI3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM268Q5VZI3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM268Q5VZI3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM268Q5VZI3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM268Q5VZI3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM268Q5VZI3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM268Q5VZI3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM268Q5VZI3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM268Q5VZI3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM268Q5VZI3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM268Q5VZI3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM268Q5VZI3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM268Q5VZI3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM268Q5VZI3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM268Q5VZI3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM268Q5VZI3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM268Q5VZI3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM268Q5VZI3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM268Q5VZI3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM268Q5VZI3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM268Q5VZI3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM268Q5VZI3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM268Q5VZI3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM268Q5VZI3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM268Q5VZI3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM268Q5VZI3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM268Q5VZI3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms