Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL5A1-AS1Q5SY13 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL5A1-AS1Q5SY13 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL5A1-AS1Q5SY13 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL5A1-AS1Q5SY13 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL5A1-AS1Q5SY13 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL5A1-AS1Q5SY13 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL5A1-AS1Q5SY13 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL5A1-AS1Q5SY13 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL5A1-AS1Q5SY13 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL5A1-AS1Q5SY13 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL5A1-AS1Q5SY13 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL5A1-AS1Q5SY13 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COL5A1-AS1Q5SY13 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL5A1-AS1Q5SY13 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL5A1-AS1Q5SY13 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL5A1-AS1Q5SY13 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL5A1-AS1Q5SY13 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL5A1-AS1Q5SY13 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL5A1-AS1Q5SY13 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL5A1-AS1Q5SY13 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL5A1-AS1Q5SY13 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL5A1-AS1Q5SY13 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL5A1-AS1Q5SY13 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL5A1-AS1Q5SY13 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL5A1-AS1Q5SY13 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL5A1-AS1Q5SY13 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL5A1-AS1Q5SY13 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL5A1-AS1Q5SY13 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL5A1-AS1Q5SY13 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL5A1-AS1Q5SY13 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL5A1-AS1Q5SY13 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL5A1-AS1Q5SY13 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL5A1-AS1Q5SY13 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL5A1-AS1Q5SY13 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COL5A1-AS1Q5SY13 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL5A1-AS1Q5SY13 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL5A1-AS1Q5SY13 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL5A1-AS1Q5SY13 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL5A1-AS1Q5SY13 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL5A1-AS1Q5SY13 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL5A1-AS1Q5SY13 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL5A1-AS1Q5SY13 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL5A1-AS1Q5SY13 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL5A1-AS1Q5SY13 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL5A1-AS1Q5SY13 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL5A1-AS1Q5SY13 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL5A1-AS1Q5SY13 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL5A1-AS1Q5SY13 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL5A1-AS1Q5SY13 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL5A1-AS1Q5SY13 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL5A1-AS1Q5SY13 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL5A1-AS1Q5SY13 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL5A1-AS1Q5SY13 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL5A1-AS1Q5SY13 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL5A1-AS1Q5SY13 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL5A1-AS1Q5SY13 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL5A1-AS1Q5SY13 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL5A1-AS1Q5SY13 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL5A1-AS1Q5SY13 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL5A1-AS1Q5SY13 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms