Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL39P5Q59GN2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL39P5Q59GN2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL39P5Q59GN2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL39P5Q59GN2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL39P5Q59GN2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL39P5Q59GN2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL39P5Q59GN2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL39P5Q59GN2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL39P5Q59GN2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL39P5Q59GN2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL39P5Q59GN2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL39P5Q59GN2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL39P5Q59GN2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL39P5Q59GN2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL39P5Q59GN2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL39P5Q59GN2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL39P5Q59GN2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL39P5Q59GN2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL39P5Q59GN2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL39P5Q59GN2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL39P5Q59GN2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL39P5Q59GN2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL39P5Q59GN2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL39P5Q59GN2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL39P5Q59GN2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL39P5Q59GN2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL39P5Q59GN2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL39P5Q59GN2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL39P5Q59GN2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL39P5Q59GN2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL39P5Q59GN2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL39P5Q59GN2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL39P5Q59GN2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL39P5Q59GN2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL39P5Q59GN2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL39P5Q59GN2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL39P5Q59GN2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL39P5Q59GN2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL39P5Q59GN2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL39P5Q59GN2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL39P5Q59GN2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL39P5Q59GN2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL39P5Q59GN2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL39P5Q59GN2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL39P5Q59GN2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL39P5Q59GN2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL39P5Q59GN2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL39P5Q59GN2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL39P5Q59GN2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL39P5Q59GN2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL39P5Q59GN2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL39P5Q59GN2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL39P5Q59GN2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL39P5Q59GN2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL39P5Q59GN2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL39P5Q59GN2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL39P5Q59GN2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL39P5Q59GN2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL39P5Q59GN2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL39P5Q59GN2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL39P5Q59GN2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL39P5Q59GN2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL39P5Q59GN2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL39P5Q59GN2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL39P5Q59GN2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL39P5Q59GN2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL39P5Q59GN2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms