Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GREB1Q4ZG55 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GREB1Q4ZG55 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GREB1Q4ZG55 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GREB1Q4ZG55 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GREB1Q4ZG55 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GREB1Q4ZG55 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GREB1Q4ZG55 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GREB1Q4ZG55 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GREB1Q4ZG55 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GREB1Q4ZG55 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GREB1Q4ZG55 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GREB1Q4ZG55 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GREB1Q4ZG55 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GREB1Q4ZG55 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GREB1Q4ZG55 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GREB1Q4ZG55 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GREB1Q4ZG55 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GREB1Q4ZG55 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GREB1Q4ZG55 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GREB1Q4ZG55 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GREB1Q4ZG55 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GREB1Q4ZG55 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GREB1Q4ZG55 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GREB1Q4ZG55 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GREB1Q4ZG55 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GREB1Q4ZG55 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GREB1Q4ZG55 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GREB1Q4ZG55 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GREB1Q4ZG55 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GREB1Q4ZG55 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GREB1Q4ZG55 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GREB1Q4ZG55 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GREB1Q4ZG55 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GREB1Q4ZG55 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GREB1Q4ZG55 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GREB1Q4ZG55 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GREB1Q4ZG55 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GREB1Q4ZG55 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GREB1Q4ZG55 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GREB1Q4ZG55 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GREB1Q4ZG55 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GREB1Q4ZG55 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GREB1Q4ZG55 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GREB1Q4ZG55 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GREB1Q4ZG55 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GREB1Q4ZG55 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GREB1Q4ZG55 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GREB1Q4ZG55 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GREB1Q4ZG55 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GREB1Q4ZG55 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GREB1Q4ZG55 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GREB1Q4ZG55 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GREB1Q4ZG55 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GREB1Q4ZG55 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GREB1Q4ZG55 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GREB1Q4ZG55 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GREB1Q4ZG55 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GREB1Q4ZG55 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GREB1Q4ZG55 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GREB1Q4ZG55 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GREB1Q4ZG55 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GREB1Q4ZG55 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GREB1Q4ZG55 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GREB1Q4ZG55 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GREB1Q4ZG55 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GREB1Q4ZG55 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GREB1Q4ZG55 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GREB1Q4ZG55 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GREB1Q4ZG55 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GREB1Q4ZG55 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GREB1Q4ZG55 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GREB1Q4ZG55 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GREB1Q4ZG55 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GREB1Q4ZG55 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GREB1Q4ZG55 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GREB1Q4ZG55 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GREB1Q4ZG55 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GREB1Q4ZG55 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
GREB1Q4ZG55 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GREB1Q4ZG55 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GREB1Q4ZG55 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GREB1Q4ZG55 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GREB1Q4ZG55 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GREB1Q4ZG55 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GREB1Q4ZG55 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GREB1Q4ZG55 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GREB1Q4ZG55 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GREB1Q4ZG55 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GREB1Q4ZG55 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GREB1Q4ZG55 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GREB1Q4ZG55 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GREB1Q4ZG55 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GREB1Q4ZG55 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GREB1Q4ZG55 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GREB1Q4ZG55 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GREB1Q4ZG55 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GREB1Q4ZG55 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GREB1Q4ZG55 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GREB1Q4ZG55 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms