Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KHDC1Q4VXA5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KHDC1Q4VXA5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KHDC1Q4VXA5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KHDC1Q4VXA5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KHDC1Q4VXA5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KHDC1Q4VXA5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KHDC1Q4VXA5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KHDC1Q4VXA5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KHDC1Q4VXA5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KHDC1Q4VXA5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KHDC1Q4VXA5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KHDC1Q4VXA5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KHDC1Q4VXA5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KHDC1Q4VXA5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KHDC1Q4VXA5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KHDC1Q4VXA5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KHDC1Q4VXA5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KHDC1Q4VXA5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KHDC1Q4VXA5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KHDC1Q4VXA5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KHDC1Q4VXA5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KHDC1Q4VXA5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KHDC1Q4VXA5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KHDC1Q4VXA5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KHDC1Q4VXA5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KHDC1Q4VXA5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KHDC1Q4VXA5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KHDC1Q4VXA5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KHDC1Q4VXA5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KHDC1Q4VXA5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KHDC1Q4VXA5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KHDC1Q4VXA5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KHDC1Q4VXA5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KHDC1Q4VXA5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KHDC1Q4VXA5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KHDC1Q4VXA5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KHDC1Q4VXA5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KHDC1Q4VXA5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KHDC1Q4VXA5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KHDC1Q4VXA5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KHDC1Q4VXA5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KHDC1Q4VXA5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KHDC1Q4VXA5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KHDC1Q4VXA5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KHDC1Q4VXA5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KHDC1Q4VXA5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KHDC1Q4VXA5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KHDC1Q4VXA5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KHDC1Q4VXA5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KHDC1Q4VXA5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KHDC1Q4VXA5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KHDC1Q4VXA5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KHDC1Q4VXA5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KHDC1Q4VXA5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KHDC1Q4VXA5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KHDC1Q4VXA5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KHDC1Q4VXA5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KHDC1Q4VXA5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KHDC1Q4VXA5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KHDC1Q4VXA5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KHDC1Q4VXA5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
KHDC1Q4VXA5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KHDC1Q4VXA5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KHDC1Q4VXA5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KHDC1Q4VXA5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KHDC1Q4VXA5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KHDC1Q4VXA5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KHDC1Q4VXA5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KHDC1Q4VXA5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KHDC1Q4VXA5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KHDC1Q4VXA5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KHDC1Q4VXA5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KHDC1Q4VXA5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KHDC1Q4VXA5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KHDC1Q4VXA5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KHDC1Q4VXA5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KHDC1Q4VXA5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KHDC1Q4VXA5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KHDC1Q4VXA5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KHDC1Q4VXA5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KHDC1Q4VXA5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KHDC1Q4VXA5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms