Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1FQ16864 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1FQ16864 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1FQ16864 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1FQ16864 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1FQ16864 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1FQ16864 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1FQ16864 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1FQ16864 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1FQ16864 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1FQ16864 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1FQ16864 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1FQ16864 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1FQ16864 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1FQ16864 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1FQ16864 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1FQ16864 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1FQ16864 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1FQ16864 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1FQ16864 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1FQ16864 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1FQ16864 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1FQ16864 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1FQ16864 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1FQ16864 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1FQ16864 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1FQ16864 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1FQ16864 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1FQ16864 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1FQ16864 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1FQ16864 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1FQ16864 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1FQ16864 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1FQ16864 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1FQ16864 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1FQ16864 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1FQ16864 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1FQ16864 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1FQ16864 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1FQ16864 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1FQ16864 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1FQ16864 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1FQ16864 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1FQ16864 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1FQ16864 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1FQ16864 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1FQ16864 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1FQ16864 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6V1FQ16864 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6V1FQ16864 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6V1FQ16864 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6V1FQ16864 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6V1FQ16864 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6V1FQ16864 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6V1FQ16864 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6V1FQ16864 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6V1FQ16864 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6V1FQ16864 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6V1FQ16864 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP6V1FQ16864 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP6V1FQ16864 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP6V1FQ16864 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP6V1FQ16864 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP6V1FQ16864 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP6V1FQ16864 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP6V1FQ16864 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP6V1FQ16864 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP6V1FQ16864 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP6V1FQ16864 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP6V1FQ16864 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP6V1FQ16864 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6V1FQ16864 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6V1FQ16864 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6V1FQ16864 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6V1FQ16864 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6V1FQ16864 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6V1FQ16864 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6V1FQ16864 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6V1FQ16864 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6V1FQ16864 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6V1FQ16864 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6V1FQ16864 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6V1FQ16864 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP6V1FQ16864 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP6V1FQ16864 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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