Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGCAQ16586 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCAQ16586 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCAQ16586 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCAQ16586 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGCAQ16586 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGCAQ16586 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGCAQ16586 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCAQ16586 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCAQ16586 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCAQ16586 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCAQ16586 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCAQ16586 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCAQ16586 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGCAQ16586 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGCAQ16586 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGCAQ16586 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCAQ16586 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCAQ16586 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCAQ16586 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGCAQ16586 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGCAQ16586 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCAQ16586 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCAQ16586 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCAQ16586 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCAQ16586 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCAQ16586 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCAQ16586 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCAQ16586 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCAQ16586 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCAQ16586 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCAQ16586 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGCAQ16586 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGCAQ16586 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGCAQ16586 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCAQ16586 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCAQ16586 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGCAQ16586 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGCAQ16586 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGCAQ16586 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGCAQ16586 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCAQ16586 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCAQ16586 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGCAQ16586 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGCAQ16586 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGCAQ16586 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGCAQ16586 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGCAQ16586 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGCAQ16586 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGCAQ16586 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCAQ16586 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCAQ16586 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCAQ16586 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCAQ16586 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCAQ16586 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SGCAQ16586 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCAQ16586 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCAQ16586 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCAQ16586 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGCAQ16586 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCAQ16586 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCAQ16586 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGCAQ16586 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGCAQ16586 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGCAQ16586 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGCAQ16586 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGCAQ16586 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SGCAQ16586 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGCAQ16586 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGCAQ16586 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGCAQ16586 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGCAQ16586 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGCAQ16586 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGCAQ16586 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGCAQ16586 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGCAQ16586 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGCAQ16586 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGCAQ16586 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGCAQ16586 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGCAQ16586 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGCAQ16586 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGCAQ16586 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGCAQ16586 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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