Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USF2Q15853 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USF2Q15853 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USF2Q15853 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USF2Q15853 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USF2Q15853 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USF2Q15853 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USF2Q15853 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USF2Q15853 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USF2Q15853 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USF2Q15853 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USF2Q15853 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USF2Q15853 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USF2Q15853 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USF2Q15853 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USF2Q15853 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USF2Q15853 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USF2Q15853 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USF2Q15853 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USF2Q15853 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USF2Q15853 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USF2Q15853 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USF2Q15853 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USF2Q15853 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USF2Q15853 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USF2Q15853 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USF2Q15853 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USF2Q15853 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USF2Q15853 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USF2Q15853 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USF2Q15853 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USF2Q15853 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USF2Q15853 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USF2Q15853 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USF2Q15853 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USF2Q15853 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USF2Q15853 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USF2Q15853 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USF2Q15853 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USF2Q15853 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USF2Q15853 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USF2Q15853 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USF2Q15853 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USF2Q15853 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USF2Q15853 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USF2Q15853 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USF2Q15853 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USF2Q15853 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USF2Q15853 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USF2Q15853 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USF2Q15853 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USF2Q15853 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USF2Q15853 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USF2Q15853 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USF2Q15853 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USF2Q15853 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USF2Q15853 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USF2Q15853 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USF2Q15853 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USF2Q15853 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USF2Q15853 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USF2Q15853 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USF2Q15853 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USF2Q15853 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USF2Q15853 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USF2Q15853 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USF2Q15853 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USF2Q15853 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USF2Q15853 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USF2Q15853 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USF2Q15853 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USF2Q15853 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USF2Q15853 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USF2Q15853 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USF2Q15853 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USF2Q15853 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USF2Q15853 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USF2Q15853 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USF2Q15853 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USF2Q15853 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USF2Q15853 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USF2Q15853 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USF2Q15853 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USF2Q15853 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USF2Q15853 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USF2Q15853 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USF2Q15853 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USF2Q15853 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USF2Q15853 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USF2Q15853 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USF2Q15853 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USF2Q15853 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USF2Q15853 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USF2Q15853 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USF2Q15853 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USF2Q15853 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USF2Q15853 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USF2Q15853 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
USF2Q15853 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USF2Q15853 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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