Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC23BQ15437 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC23BQ15437 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC23BQ15437 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC23BQ15437 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC23BQ15437 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC23BQ15437 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC23BQ15437 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC23BQ15437 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC23BQ15437 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC23BQ15437 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC23BQ15437 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC23BQ15437 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC23BQ15437 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC23BQ15437 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC23BQ15437 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC23BQ15437 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC23BQ15437 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC23BQ15437 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC23BQ15437 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC23BQ15437 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC23BQ15437 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC23BQ15437 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC23BQ15437 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC23BQ15437 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC23BQ15437 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC23BQ15437 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC23BQ15437 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC23BQ15437 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC23BQ15437 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC23BQ15437 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC23BQ15437 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC23BQ15437 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC23BQ15437 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC23BQ15437 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC23BQ15437 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC23BQ15437 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC23BQ15437 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC23BQ15437 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC23BQ15437 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC23BQ15437 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC23BQ15437 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC23BQ15437 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC23BQ15437 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC23BQ15437 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC23BQ15437 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC23BQ15437 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC23BQ15437 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC23BQ15437 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC23BQ15437 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC23BQ15437 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC23BQ15437 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC23BQ15437 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC23BQ15437 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC23BQ15437 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC23BQ15437 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC23BQ15437 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC23BQ15437 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC23BQ15437 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC23BQ15437 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC23BQ15437 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC23BQ15437 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC23BQ15437 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC23BQ15437 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC23BQ15437 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC23BQ15437 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC23BQ15437 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC23BQ15437 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC23BQ15437 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC23BQ15437 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC23BQ15437 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC23BQ15437 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC23BQ15437 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC23BQ15437 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC23BQ15437 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC23BQ15437 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC23BQ15437 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC23BQ15437 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC23BQ15437 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC23BQ15437 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC23BQ15437 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC23BQ15437 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC23BQ15437 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC23BQ15437 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC23BQ15437 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC23BQ15437 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC23BQ15437 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC23BQ15437 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC23BQ15437 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC23BQ15437 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC23BQ15437 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC23BQ15437 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC23BQ15437 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC23BQ15437 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC23BQ15437 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC23BQ15437 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC23BQ15437 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC23BQ15437 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEC23BQ15437 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC23BQ15437 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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