Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPS6KA1Q15418 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPS6KA1Q15418 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPS6KA1Q15418 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPS6KA1Q15418 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPS6KA1Q15418 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPS6KA1Q15418 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPS6KA1Q15418 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPS6KA1Q15418 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPS6KA1Q15418 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPS6KA1Q15418 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPS6KA1Q15418 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPS6KA1Q15418 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPS6KA1Q15418 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPS6KA1Q15418 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPS6KA1Q15418 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPS6KA1Q15418 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPS6KA1Q15418 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPS6KA1Q15418 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPS6KA1Q15418 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPS6KA1Q15418 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPS6KA1Q15418 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPS6KA1Q15418 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPS6KA1Q15418 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPS6KA1Q15418 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPS6KA1Q15418 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPS6KA1Q15418 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPS6KA1Q15418 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPS6KA1Q15418 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPS6KA1Q15418 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RPS6KA1Q15418 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPS6KA1Q15418 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPS6KA1Q15418 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPS6KA1Q15418 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPS6KA1Q15418 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPS6KA1Q15418 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPS6KA1Q15418 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPS6KA1Q15418 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPS6KA1Q15418 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPS6KA1Q15418 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPS6KA1Q15418 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPS6KA1Q15418 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPS6KA1Q15418 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPS6KA1Q15418 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPS6KA1Q15418 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPS6KA1Q15418 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPS6KA1Q15418 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA1Q15418 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA1Q15418 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA1Q15418 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KA1Q15418 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KA1Q15418 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KA1Q15418 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KA1Q15418 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPS6KA1Q15418 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPS6KA1Q15418 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA1Q15418 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KA1Q15418 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KA1Q15418 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPS6KA1Q15418 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KA1Q15418 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KA1Q15418 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPS6KA1Q15418 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPS6KA1Q15418 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPS6KA1Q15418 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPS6KA1Q15418 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPS6KA1Q15418 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPS6KA1Q15418 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPS6KA1Q15418 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPS6KA1Q15418 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPS6KA1Q15418 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPS6KA1Q15418 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPS6KA1Q15418 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPS6KA1Q15418 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPS6KA1Q15418 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPS6KA1Q15418 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPS6KA1Q15418 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPS6KA1Q15418 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPS6KA1Q15418 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPS6KA1Q15418 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS6KA1Q15418 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS6KA1Q15418 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPS6KA1Q15418 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPS6KA1Q15418 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPS6KA1Q15418 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KA1Q15418 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KA1Q15418 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KA1Q15418 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KA1Q15418 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RPS6KA1Q15418 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPS6KA1Q15418 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPS6KA1Q15418 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPS6KA1Q15418 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPS6KA1Q15418 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPS6KA1Q15418 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPS6KA1Q15418 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KA1Q15418 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPS6KA1Q15418 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPS6KA1Q15418 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPS6KA1Q15418 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
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