Protein–RNA interactions for Protein: Q15291

RBBP5, Retinoblastoma-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP5Q15291 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBBP5Q15291 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBBP5Q15291 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBBP5Q15291 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBBP5Q15291 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBBP5Q15291 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBBP5Q15291 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBBP5Q15291 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBBP5Q15291 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBBP5Q15291 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBBP5Q15291 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBBP5Q15291 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBBP5Q15291 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBBP5Q15291 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBBP5Q15291 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBBP5Q15291 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBBP5Q15291 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBBP5Q15291 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBBP5Q15291 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBBP5Q15291 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBBP5Q15291 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBBP5Q15291 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBBP5Q15291 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBBP5Q15291 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP5Q15291 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP5Q15291 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP5Q15291 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBBP5Q15291 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBBP5Q15291 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RBBP5Q15291 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RBBP5Q15291 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RBBP5Q15291 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBBP5Q15291 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBBP5Q15291 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBBP5Q15291 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBBP5Q15291 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBBP5Q15291 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBBP5Q15291 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBBP5Q15291 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBBP5Q15291 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBBP5Q15291 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBBP5Q15291 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBBP5Q15291 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBBP5Q15291 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBBP5Q15291 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RBBP5Q15291 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBBP5Q15291 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBBP5Q15291 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBBP5Q15291 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBBP5Q15291 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBBP5Q15291 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBBP5Q15291 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBBP5Q15291 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBBP5Q15291 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBBP5Q15291 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBBP5Q15291 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBBP5Q15291 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBBP5Q15291 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBBP5Q15291 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBBP5Q15291 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBBP5Q15291 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBBP5Q15291 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBBP5Q15291 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBBP5Q15291 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBBP5Q15291 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBBP5Q15291 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBBP5Q15291 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBBP5Q15291 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBBP5Q15291 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBBP5Q15291 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBBP5Q15291 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBBP5Q15291 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBBP5Q15291 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBBP5Q15291 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBBP5Q15291 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBBP5Q15291 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBBP5Q15291 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBBP5Q15291 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBBP5Q15291 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBBP5Q15291 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBBP5Q15291 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBBP5Q15291 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBBP5Q15291 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RBBP5Q15291 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBBP5Q15291 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBBP5Q15291 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBBP5Q15291 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBBP5Q15291 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBBP5Q15291 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBBP5Q15291 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBBP5Q15291 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBBP5Q15291 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBBP5Q15291 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBBP5Q15291 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBBP5Q15291 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RBBP5Q15291 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBBP5Q15291 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBBP5Q15291 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBBP5Q15291 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBBP5Q15291 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms