Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
KARSQ15046 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
KARSQ15046 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
KARSQ15046 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
KARSQ15046 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
KARSQ15046 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KARSQ15046 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
KARSQ15046 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KARSQ15046 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KARSQ15046 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
KARSQ15046 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KARSQ15046 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KARSQ15046 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
KARSQ15046 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
KARSQ15046 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KARSQ15046 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KARSQ15046 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KARSQ15046 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KARSQ15046 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KARSQ15046 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
KARSQ15046 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KARSQ15046 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KARSQ15046 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
KARSQ15046 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
KARSQ15046 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KARSQ15046 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KARSQ15046 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KARSQ15046 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KARSQ15046 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
KARSQ15046 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KARSQ15046 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KARSQ15046 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KARSQ15046 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
KARSQ15046 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KARSQ15046 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
KARSQ15046 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KARSQ15046 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KARSQ15046 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KARSQ15046 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
KARSQ15046 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KARSQ15046 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KARSQ15046 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
KARSQ15046 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KARSQ15046 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KARSQ15046 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KARSQ15046 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KARSQ15046 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KARSQ15046 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KARSQ15046 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KARSQ15046 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KARSQ15046 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KARSQ15046 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KARSQ15046 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KARSQ15046 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KARSQ15046 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
KARSQ15046 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
KARSQ15046 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KARSQ15046 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KARSQ15046 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KARSQ15046 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
KARSQ15046 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
KARSQ15046 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KARSQ15046 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KARSQ15046 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KARSQ15046 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KARSQ15046 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KARSQ15046 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KARSQ15046 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
KARSQ15046 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KARSQ15046 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KARSQ15046 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KARSQ15046 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KARSQ15046 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KARSQ15046 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KARSQ15046 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KARSQ15046 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KARSQ15046 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KARSQ15046 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KARSQ15046 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KARSQ15046 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KARSQ15046 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KARSQ15046 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KARSQ15046 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KARSQ15046 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KARSQ15046 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KARSQ15046 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KARSQ15046 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KARSQ15046 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KARSQ15046 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KARSQ15046 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
KARSQ15046 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KARSQ15046 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KARSQ15046 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KARSQ15046 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KARSQ15046 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KARSQ15046 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KARSQ15046 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KARSQ15046 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KARSQ15046 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KARSQ15046 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
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