Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBB3Q13509 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBB3Q13509 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBB3Q13509 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB3Q13509 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB3Q13509 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUBB3Q13509 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBB3Q13509 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBB3Q13509 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBB3Q13509 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBB3Q13509 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBB3Q13509 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBB3Q13509 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBB3Q13509 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBB3Q13509 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBB3Q13509 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBB3Q13509 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBB3Q13509 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBB3Q13509 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBB3Q13509 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBB3Q13509 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBB3Q13509 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBB3Q13509 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBB3Q13509 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TUBB3Q13509 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TUBB3Q13509 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TUBB3Q13509 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUBB3Q13509 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TUBB3Q13509 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB3Q13509 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TUBB3Q13509 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TUBB3Q13509 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TUBB3Q13509 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUBB3Q13509 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUBB3Q13509 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBB3Q13509 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBB3Q13509 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBB3Q13509 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBB3Q13509 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB3Q13509 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBB3Q13509 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBB3Q13509 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB3Q13509 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB3Q13509 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB3Q13509 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB3Q13509 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBB3Q13509 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBB3Q13509 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBB3Q13509 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBB3Q13509 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBB3Q13509 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB3Q13509 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB3Q13509 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB3Q13509 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB3Q13509 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB3Q13509 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB3Q13509 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB3Q13509 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB3Q13509 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB3Q13509 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBB3Q13509 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBB3Q13509 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBB3Q13509 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TUBB3Q13509 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TUBB3Q13509 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBB3Q13509 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBB3Q13509 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBB3Q13509 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBB3Q13509 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBB3Q13509 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBB3Q13509 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB3Q13509 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBB3Q13509 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBB3Q13509 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB3Q13509 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBB3Q13509 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBB3Q13509 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBB3Q13509 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBB3Q13509 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB3Q13509 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBB3Q13509 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBB3Q13509 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBB3Q13509 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBB3Q13509 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB3Q13509 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB3Q13509 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB3Q13509 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB3Q13509 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBB3Q13509 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBB3Q13509 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBB3Q13509 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB3Q13509 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB3Q13509 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB3Q13509 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB3Q13509 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB3Q13509 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB3Q13509 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB3Q13509 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB3Q13509 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBB3Q13509 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
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