Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MTA1Q13330 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MTA1Q13330 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTA1Q13330 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTA1Q13330 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTA1Q13330 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTA1Q13330 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MTA1Q13330 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MTA1Q13330 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MTA1Q13330 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTA1Q13330 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MTA1Q13330 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MTA1Q13330 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTA1Q13330 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTA1Q13330 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTA1Q13330 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MTA1Q13330 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MTA1Q13330 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTA1Q13330 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTA1Q13330 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MTA1Q13330 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTA1Q13330 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTA1Q13330 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTA1Q13330 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTA1Q13330 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTA1Q13330 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTA1Q13330 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTA1Q13330 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTA1Q13330 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTA1Q13330 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTA1Q13330 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTA1Q13330 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTA1Q13330 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTA1Q13330 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MTA1Q13330 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTA1Q13330 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTA1Q13330 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTA1Q13330 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTA1Q13330 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTA1Q13330 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MTA1Q13330 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTA1Q13330 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTA1Q13330 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTA1Q13330 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTA1Q13330 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTA1Q13330 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTA1Q13330 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTA1Q13330 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTA1Q13330 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTA1Q13330 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTA1Q13330 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTA1Q13330 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTA1Q13330 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTA1Q13330 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MTA1Q13330 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTA1Q13330 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTA1Q13330 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTA1Q13330 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTA1Q13330 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTA1Q13330 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTA1Q13330 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTA1Q13330 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTA1Q13330 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTA1Q13330 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTA1Q13330 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTA1Q13330 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTA1Q13330 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTA1Q13330 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTA1Q13330 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTA1Q13330 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTA1Q13330 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTA1Q13330 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTA1Q13330 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTA1Q13330 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTA1Q13330 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTA1Q13330 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTA1Q13330 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTA1Q13330 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTA1Q13330 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTA1Q13330 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTA1Q13330 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTA1Q13330 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MTA1Q13330 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MTA1Q13330 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTA1Q13330 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTA1Q13330 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTA1Q13330 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MTA1Q13330 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTA1Q13330 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTA1Q13330 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTA1Q13330 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTA1Q13330 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTA1Q13330 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MTA1Q13330 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTA1Q13330 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTA1Q13330 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTA1Q13330 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTA1Q13330 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTA1Q13330 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTA1Q13330 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms