Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
MTA1Q13330 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MTA1Q13330 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MTA1Q13330 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
MTA1Q13330 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MTA1Q13330 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MTA1Q13330 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MTA1Q13330 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MTA1Q13330 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
MTA1Q13330 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MTA1Q13330 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
MTA1Q13330 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MTA1Q13330 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MTA1Q13330 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
MTA1Q13330 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MTA1Q13330 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MTA1Q13330 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MTA1Q13330 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MTA1Q13330 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MTA1Q13330 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MTA1Q13330 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MTA1Q13330 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MTA1Q13330 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
MTA1Q13330 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MTA1Q13330 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MTA1Q13330 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
MTA1Q13330 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MTA1Q13330 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MTA1Q13330 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MTA1Q13330 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MTA1Q13330 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MTA1Q13330 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MTA1Q13330 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MTA1Q13330 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MTA1Q13330 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MTA1Q13330 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MTA1Q13330 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MTA1Q13330 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MTA1Q13330 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MTA1Q13330 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MTA1Q13330 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MTA1Q13330 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MTA1Q13330 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
MTA1Q13330 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MTA1Q13330 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MTA1Q13330 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MTA1Q13330 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
MTA1Q13330 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
MTA1Q13330 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MTA1Q13330 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MTA1Q13330 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MTA1Q13330 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MTA1Q13330 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MTA1Q13330 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MTA1Q13330 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MTA1Q13330 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MTA1Q13330 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
MTA1Q13330 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MTA1Q13330 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MTA1Q13330 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MTA1Q13330 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MTA1Q13330 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MTA1Q13330 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MTA1Q13330 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
MTA1Q13330 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MTA1Q13330 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MTA1Q13330 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MTA1Q13330 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
MTA1Q13330 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MTA1Q13330 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MTA1Q13330 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MTA1Q13330 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MTA1Q13330 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MTA1Q13330 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MTA1Q13330 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MTA1Q13330 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MTA1Q13330 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MTA1Q13330 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MTA1Q13330 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MTA1Q13330 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MTA1Q13330 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MTA1Q13330 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MTA1Q13330 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MTA1Q13330 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MTA1Q13330 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MTA1Q13330 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MTA1Q13330 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MTA1Q13330 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MTA1Q13330 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MTA1Q13330 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MTA1Q13330 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MTA1Q13330 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MTA1Q13330 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MTA1Q13330 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30■■■□□ 2.39
MTA1Q13330 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MTA1Q13330 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MTA1Q13330 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTA1Q13330 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTA1Q13330 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTA1Q13330 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
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