Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN1Q05586 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN1Q05586 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN1Q05586 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN1Q05586 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN1Q05586 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN1Q05586 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN1Q05586 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GRIN1Q05586 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN1Q05586 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GRIN1Q05586 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN1Q05586 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN1Q05586 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN1Q05586 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN1Q05586 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN1Q05586 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN1Q05586 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN1Q05586 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN1Q05586 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN1Q05586 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN1Q05586 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN1Q05586 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN1Q05586 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN1Q05586 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN1Q05586 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN1Q05586 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN1Q05586 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN1Q05586 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN1Q05586 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN1Q05586 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN1Q05586 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIN1Q05586 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIN1Q05586 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN1Q05586 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GRIN1Q05586 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN1Q05586 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN1Q05586 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN1Q05586 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN1Q05586 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN1Q05586 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIN1Q05586 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIN1Q05586 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIN1Q05586 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN1Q05586 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN1Q05586 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN1Q05586 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN1Q05586 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN1Q05586 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN1Q05586 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN1Q05586 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN1Q05586 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN1Q05586 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN1Q05586 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN1Q05586 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN1Q05586 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN1Q05586 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN1Q05586 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN1Q05586 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN1Q05586 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN1Q05586 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN1Q05586 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN1Q05586 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN1Q05586 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN1Q05586 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN1Q05586 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN1Q05586 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN1Q05586 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN1Q05586 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN1Q05586 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN1Q05586 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN1Q05586 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN1Q05586 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN1Q05586 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN1Q05586 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN1Q05586 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN1Q05586 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN1Q05586 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN1Q05586 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN1Q05586 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN1Q05586 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN1Q05586 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN1Q05586 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN1Q05586 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN1Q05586 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN1Q05586 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms