Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NFKB2Q00653 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFKB2Q00653 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFKB2Q00653 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NFKB2Q00653 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFKB2Q00653 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NFKB2Q00653 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKB2Q00653 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKB2Q00653 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKB2Q00653 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKB2Q00653 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKB2Q00653 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKB2Q00653 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKB2Q00653 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKB2Q00653 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKB2Q00653 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFKB2Q00653 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFKB2Q00653 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFKB2Q00653 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFKB2Q00653 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFKB2Q00653 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFKB2Q00653 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFKB2Q00653 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NFKB2Q00653 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFKB2Q00653 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFKB2Q00653 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFKB2Q00653 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKB2Q00653 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKB2Q00653 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKB2Q00653 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKB2Q00653 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFKB2Q00653 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFKB2Q00653 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFKB2Q00653 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFKB2Q00653 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFKB2Q00653 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFKB2Q00653 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFKB2Q00653 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKB2Q00653 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKB2Q00653 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKB2Q00653 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKB2Q00653 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKB2Q00653 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKB2Q00653 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKB2Q00653 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKB2Q00653 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKB2Q00653 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFKB2Q00653 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFKB2Q00653 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKB2Q00653 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKB2Q00653 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKB2Q00653 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKB2Q00653 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKB2Q00653 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKB2Q00653 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKB2Q00653 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFKB2Q00653 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKB2Q00653 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKB2Q00653 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKB2Q00653 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFKB2Q00653 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKB2Q00653 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKB2Q00653 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKB2Q00653 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKB2Q00653 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKB2Q00653 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKB2Q00653 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKB2Q00653 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKB2Q00653 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFKB2Q00653 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFKB2Q00653 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFKB2Q00653 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFKB2Q00653 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFKB2Q00653 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKB2Q00653 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKB2Q00653 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKB2Q00653 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKB2Q00653 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKB2Q00653 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKB2Q00653 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKB2Q00653 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKB2Q00653 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKB2Q00653 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFKB2Q00653 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFKB2Q00653 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKB2Q00653 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKB2Q00653 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKB2Q00653 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKB2Q00653 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFKB2Q00653 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFKB2Q00653 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NFKB2Q00653 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKB2Q00653 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKB2Q00653 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFKB2Q00653 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NFKB2Q00653 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFKB2Q00653 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKB2Q00653 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NFKB2Q00653 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFKB2Q00653 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms