Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSF1Q00613 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSF1Q00613 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSF1Q00613 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSF1Q00613 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HSF1Q00613 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSF1Q00613 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSF1Q00613 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSF1Q00613 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSF1Q00613 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSF1Q00613 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSF1Q00613 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSF1Q00613 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSF1Q00613 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSF1Q00613 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSF1Q00613 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSF1Q00613 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSF1Q00613 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSF1Q00613 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSF1Q00613 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSF1Q00613 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSF1Q00613 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSF1Q00613 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSF1Q00613 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSF1Q00613 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSF1Q00613 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSF1Q00613 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSF1Q00613 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSF1Q00613 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSF1Q00613 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSF1Q00613 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSF1Q00613 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSF1Q00613 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSF1Q00613 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSF1Q00613 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HSF1Q00613 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HSF1Q00613 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSF1Q00613 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSF1Q00613 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSF1Q00613 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSF1Q00613 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSF1Q00613 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSF1Q00613 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSF1Q00613 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HSF1Q00613 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSF1Q00613 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSF1Q00613 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSF1Q00613 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSF1Q00613 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSF1Q00613 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HSF1Q00613 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSF1Q00613 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSF1Q00613 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HSF1Q00613 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSF1Q00613 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSF1Q00613 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSF1Q00613 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSF1Q00613 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSF1Q00613 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSF1Q00613 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HSF1Q00613 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSF1Q00613 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSF1Q00613 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSF1Q00613 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HSF1Q00613 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSF1Q00613 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSF1Q00613 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSF1Q00613 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSF1Q00613 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSF1Q00613 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSF1Q00613 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSF1Q00613 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSF1Q00613 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSF1Q00613 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSF1Q00613 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HSF1Q00613 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSF1Q00613 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSF1Q00613 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HSF1Q00613 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSF1Q00613 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSF1Q00613 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSF1Q00613 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSF1Q00613 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms