Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUCB2P80303 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUCB2P80303 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUCB2P80303 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUCB2P80303 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUCB2P80303 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NUCB2P80303 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
NUCB2P80303 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NUCB2P80303 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NUCB2P80303 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NUCB2P80303 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NUCB2P80303 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NUCB2P80303 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUCB2P80303 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUCB2P80303 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NUCB2P80303 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NUCB2P80303 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUCB2P80303 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUCB2P80303 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUCB2P80303 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUCB2P80303 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUCB2P80303 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUCB2P80303 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUCB2P80303 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUCB2P80303 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUCB2P80303 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUCB2P80303 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUCB2P80303 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUCB2P80303 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUCB2P80303 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NUCB2P80303 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NUCB2P80303 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUCB2P80303 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUCB2P80303 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NUCB2P80303 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUCB2P80303 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUCB2P80303 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUCB2P80303 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUCB2P80303 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUCB2P80303 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUCB2P80303 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUCB2P80303 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUCB2P80303 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUCB2P80303 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUCB2P80303 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUCB2P80303 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUCB2P80303 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
NUCB2P80303 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUCB2P80303 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUCB2P80303 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUCB2P80303 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUCB2P80303 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUCB2P80303 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUCB2P80303 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NUCB2P80303 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NUCB2P80303 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUCB2P80303 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUCB2P80303 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUCB2P80303 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUCB2P80303 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUCB2P80303 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUCB2P80303 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUCB2P80303 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NUCB2P80303 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NUCB2P80303 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUCB2P80303 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUCB2P80303 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUCB2P80303 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUCB2P80303 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUCB2P80303 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUCB2P80303 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUCB2P80303 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUCB2P80303 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUCB2P80303 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUCB2P80303 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUCB2P80303 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUCB2P80303 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUCB2P80303 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUCB2P80303 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUCB2P80303 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUCB2P80303 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUCB2P80303 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUCB2P80303 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUCB2P80303 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUCB2P80303 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUCB2P80303 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NUCB2P80303 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NUCB2P80303 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUCB2P80303 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUCB2P80303 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUCB2P80303 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUCB2P80303 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUCB2P80303 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NUCB2P80303 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NUCB2P80303 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUCB2P80303 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUCB2P80303 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUCB2P80303 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NUCB2P80303 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NUCB2P80303 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms