Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFI35P80217 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
IFI35P80217 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFI35P80217 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFI35P80217 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFI35P80217 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFI35P80217 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFI35P80217 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
IFI35P80217 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFI35P80217 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFI35P80217 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFI35P80217 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFI35P80217 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFI35P80217 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFI35P80217 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFI35P80217 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFI35P80217 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFI35P80217 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFI35P80217 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFI35P80217 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFI35P80217 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFI35P80217 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFI35P80217 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFI35P80217 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFI35P80217 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFI35P80217 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFI35P80217 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFI35P80217 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFI35P80217 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFI35P80217 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFI35P80217 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFI35P80217 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
IFI35P80217 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFI35P80217 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFI35P80217 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFI35P80217 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFI35P80217 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFI35P80217 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFI35P80217 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFI35P80217 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFI35P80217 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFI35P80217 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFI35P80217 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFI35P80217 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFI35P80217 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFI35P80217 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFI35P80217 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFI35P80217 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFI35P80217 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFI35P80217 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFI35P80217 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFI35P80217 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFI35P80217 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFI35P80217 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFI35P80217 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFI35P80217 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFI35P80217 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IFI35P80217 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFI35P80217 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFI35P80217 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFI35P80217 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFI35P80217 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFI35P80217 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFI35P80217 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFI35P80217 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFI35P80217 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFI35P80217 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFI35P80217 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFI35P80217 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IFI35P80217 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFI35P80217 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFI35P80217 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFI35P80217 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFI35P80217 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFI35P80217 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFI35P80217 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFI35P80217 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFI35P80217 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFI35P80217 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFI35P80217 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFI35P80217 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFI35P80217 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFI35P80217 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFI35P80217 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFI35P80217 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFI35P80217 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFI35P80217 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFI35P80217 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFI35P80217 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFI35P80217 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFI35P80217 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IFI35P80217 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFI35P80217 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFI35P80217 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFI35P80217 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFI35P80217 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFI35P80217 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFI35P80217 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFI35P80217 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFI35P80217 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms