Protein–RNA interactions for Protein: P80188

LCN2, Neutrophil gelatinase-associated lipocalin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN2P80188 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCN2P80188 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCN2P80188 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCN2P80188 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCN2P80188 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LCN2P80188 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN2P80188 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN2P80188 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCN2P80188 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCN2P80188 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCN2P80188 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCN2P80188 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCN2P80188 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCN2P80188 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCN2P80188 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCN2P80188 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCN2P80188 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCN2P80188 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCN2P80188 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCN2P80188 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCN2P80188 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCN2P80188 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCN2P80188 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCN2P80188 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCN2P80188 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCN2P80188 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCN2P80188 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN2P80188 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN2P80188 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCN2P80188 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCN2P80188 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCN2P80188 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCN2P80188 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCN2P80188 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LCN2P80188 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LCN2P80188 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN2P80188 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN2P80188 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN2P80188 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN2P80188 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN2P80188 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN2P80188 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN2P80188 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCN2P80188 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCN2P80188 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCN2P80188 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LCN2P80188 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN2P80188 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN2P80188 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN2P80188 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN2P80188 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN2P80188 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN2P80188 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCN2P80188 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCN2P80188 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCN2P80188 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCN2P80188 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LCN2P80188 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCN2P80188 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN2P80188 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN2P80188 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN2P80188 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN2P80188 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN2P80188 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN2P80188 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN2P80188 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN2P80188 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCN2P80188 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCN2P80188 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCN2P80188 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN2P80188 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCN2P80188 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN2P80188 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN2P80188 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN2P80188 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN2P80188 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN2P80188 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCN2P80188 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN2P80188 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN2P80188 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN2P80188 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN2P80188 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN2P80188 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN2P80188 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN2P80188 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN2P80188 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN2P80188 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN2P80188 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN2P80188 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN2P80188 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN2P80188 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN2P80188 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN2P80188 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN2P80188 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN2P80188 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN2P80188 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN2P80188 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN2P80188 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN2P80188 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN2P80188 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms