Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBX1P62877 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBX1P62877 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBX1P62877 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBX1P62877 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBX1P62877 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBX1P62877 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBX1P62877 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBX1P62877 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBX1P62877 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBX1P62877 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBX1P62877 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBX1P62877 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBX1P62877 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RBX1P62877 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBX1P62877 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBX1P62877 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBX1P62877 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBX1P62877 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBX1P62877 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBX1P62877 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBX1P62877 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBX1P62877 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBX1P62877 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBX1P62877 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBX1P62877 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBX1P62877 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBX1P62877 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBX1P62877 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBX1P62877 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBX1P62877 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBX1P62877 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBX1P62877 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBX1P62877 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBX1P62877 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBX1P62877 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBX1P62877 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBX1P62877 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBX1P62877 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBX1P62877 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBX1P62877 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBX1P62877 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBX1P62877 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBX1P62877 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBX1P62877 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBX1P62877 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBX1P62877 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBX1P62877 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBX1P62877 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBX1P62877 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBX1P62877 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBX1P62877 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBX1P62877 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBX1P62877 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBX1P62877 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBX1P62877 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBX1P62877 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBX1P62877 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBX1P62877 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBX1P62877 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBX1P62877 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBX1P62877 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBX1P62877 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBX1P62877 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBX1P62877 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBX1P62877 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBX1P62877 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBX1P62877 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBX1P62877 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBX1P62877 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBX1P62877 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBX1P62877 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBX1P62877 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBX1P62877 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBX1P62877 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RBX1P62877 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBX1P62877 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBX1P62877 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBX1P62877 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBX1P62877 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBX1P62877 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBX1P62877 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBX1P62877 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBX1P62877 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBX1P62877 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBX1P62877 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBX1P62877 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBX1P62877 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBX1P62877 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBX1P62877 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBX1P62877 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBX1P62877 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBX1P62877 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBX1P62877 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBX1P62877 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBX1P62877 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RBX1P62877 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBX1P62877 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBX1P62877 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBX1P62877 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms