Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS4XP62701 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS4XP62701 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS4XP62701 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS4XP62701 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS4XP62701 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS4XP62701 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS4XP62701 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS4XP62701 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS4XP62701 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS4XP62701 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS4XP62701 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS4XP62701 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS4XP62701 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS4XP62701 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS4XP62701 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS4XP62701 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS4XP62701 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS4XP62701 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS4XP62701 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS4XP62701 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS4XP62701 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS4XP62701 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS4XP62701 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS4XP62701 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS4XP62701 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS4XP62701 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS4XP62701 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS4XP62701 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS4XP62701 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS4XP62701 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS4XP62701 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS4XP62701 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS4XP62701 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS4XP62701 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS4XP62701 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS4XP62701 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS4XP62701 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS4XP62701 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS4XP62701 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS4XP62701 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS4XP62701 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS4XP62701 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS4XP62701 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS4XP62701 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS4XP62701 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS4XP62701 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS4XP62701 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS4XP62701 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS4XP62701 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS4XP62701 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS4XP62701 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS4XP62701 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS4XP62701 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS4XP62701 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS4XP62701 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS4XP62701 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS4XP62701 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS4XP62701 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS4XP62701 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS4XP62701 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS4XP62701 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS4XP62701 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS4XP62701 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS4XP62701 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS4XP62701 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS4XP62701 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS4XP62701 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS4XP62701 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS4XP62701 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS4XP62701 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS4XP62701 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS4XP62701 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS4XP62701 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS4XP62701 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS4XP62701 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS4XP62701 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS4XP62701 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS4XP62701 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPS4XP62701 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPS4XP62701 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS4XP62701 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS4XP62701 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS4XP62701 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS4XP62701 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms