Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPD2P62316 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPD2P62316 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPD2P62316 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPD2P62316 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPD2P62316 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPD2P62316 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPD2P62316 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPD2P62316 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPD2P62316 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPD2P62316 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPD2P62316 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SNRPD2P62316 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNRPD2P62316 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNRPD2P62316 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPD2P62316 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPD2P62316 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPD2P62316 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD2P62316 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD2P62316 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD2P62316 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD2P62316 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD2P62316 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPD2P62316 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPD2P62316 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPD2P62316 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPD2P62316 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPD2P62316 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNRPD2P62316 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRPD2P62316 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPD2P62316 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPD2P62316 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPD2P62316 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPD2P62316 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPD2P62316 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPD2P62316 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPD2P62316 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPD2P62316 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPD2P62316 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPD2P62316 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPD2P62316 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPD2P62316 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPD2P62316 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPD2P62316 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPD2P62316 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPD2P62316 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPD2P62316 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPD2P62316 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPD2P62316 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPD2P62316 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPD2P62316 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPD2P62316 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPD2P62316 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPD2P62316 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPD2P62316 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPD2P62316 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPD2P62316 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPD2P62316 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPD2P62316 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPD2P62316 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRPD2P62316 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPD2P62316 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPD2P62316 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPD2P62316 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPD2P62316 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPD2P62316 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPD2P62316 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPD2P62316 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPD2P62316 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPD2P62316 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms