Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB2AP61019 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB2AP61019 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB2AP61019 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB2AP61019 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB2AP61019 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB2AP61019 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB2AP61019 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB2AP61019 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB2AP61019 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB2AP61019 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB2AP61019 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB2AP61019 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB2AP61019 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB2AP61019 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB2AP61019 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB2AP61019 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB2AP61019 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB2AP61019 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB2AP61019 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB2AP61019 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB2AP61019 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB2AP61019 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB2AP61019 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB2AP61019 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB2AP61019 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB2AP61019 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB2AP61019 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB2AP61019 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB2AP61019 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB2AP61019 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB2AP61019 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB2AP61019 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB2AP61019 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB2AP61019 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB2AP61019 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB2AP61019 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB2AP61019 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB2AP61019 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB2AP61019 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB2AP61019 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB2AP61019 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB2AP61019 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB2AP61019 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB2AP61019 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB2AP61019 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB2AP61019 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB2AP61019 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB2AP61019 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB2AP61019 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB2AP61019 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB2AP61019 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB2AP61019 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB2AP61019 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB2AP61019 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB2AP61019 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB2AP61019 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB2AP61019 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB2AP61019 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB2AP61019 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB2AP61019 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB2AP61019 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB2AP61019 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB2AP61019 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB2AP61019 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB2AP61019 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB2AP61019 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB2AP61019 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB2AP61019 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB2AP61019 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB2AP61019 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB2AP61019 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB2AP61019 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB2AP61019 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB2AP61019 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB2AP61019 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB2AP61019 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB2AP61019 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB2AP61019 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB2AP61019 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB2AP61019 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB2AP61019 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB2AP61019 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB2AP61019 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB2AP61019 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB2AP61019 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB2AP61019 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB2AP61019 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB2AP61019 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB2AP61019 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB2AP61019 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB2AP61019 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB2AP61019 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB2AP61019 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB2AP61019 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB2AP61019 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB2AP61019 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB2AP61019 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB2AP61019 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms