Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPS1P60891 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPS1P60891 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPS1P60891 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPS1P60891 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPS1P60891 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPS1P60891 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPS1P60891 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPS1P60891 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPS1P60891 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPS1P60891 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPS1P60891 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPS1P60891 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS1P60891 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS1P60891 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS1P60891 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS1P60891 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS1P60891 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS1P60891 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS1P60891 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms