Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTBP60709 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTBP60709 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTBP60709 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTBP60709 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTBP60709 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTBP60709 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTBP60709 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTBP60709 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTBP60709 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTBP60709 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTBP60709 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTBP60709 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTBP60709 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTBP60709 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTBP60709 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTBP60709 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTBP60709 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTBP60709 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTBP60709 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTBP60709 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTBP60709 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTBP60709 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTBP60709 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTBP60709 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTBP60709 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTBP60709 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTBP60709 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTBP60709 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTBP60709 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTBP60709 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTBP60709 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTBP60709 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTBP60709 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTBP60709 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTBP60709 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTBP60709 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTBP60709 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTBP60709 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTBP60709 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTBP60709 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTBP60709 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTBP60709 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTBP60709 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTBP60709 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTBP60709 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTBP60709 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTBP60709 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTBP60709 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTBP60709 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTBP60709 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTBP60709 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTBP60709 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTBP60709 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTBP60709 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTBP60709 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTBP60709 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTBP60709 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTBP60709 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTBP60709 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTBP60709 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTBP60709 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTBP60709 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTBP60709 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTBP60709 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTBP60709 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTBP60709 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTBP60709 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTBP60709 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTBP60709 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTBP60709 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTBP60709 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTBP60709 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTBP60709 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTBP60709 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTBP60709 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTBP60709 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTBP60709 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTBP60709 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTBP60709 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTBP60709 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTBP60709 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTBP60709 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTBP60709 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTBP60709 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTBP60709 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTBP60709 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTBP60709 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTBP60709 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTBP60709 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTBP60709 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTBP60709 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTBP60709 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTBP60709 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTBP60709 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTBP60709 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTBP60709 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTBP60709 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTBP60709 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTBP60709 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms