Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCBP4P57723 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCBP4P57723 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCBP4P57723 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCBP4P57723 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCBP4P57723 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCBP4P57723 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCBP4P57723 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCBP4P57723 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCBP4P57723 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCBP4P57723 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCBP4P57723 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PCBP4P57723 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCBP4P57723 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCBP4P57723 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PCBP4P57723 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCBP4P57723 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCBP4P57723 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCBP4P57723 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCBP4P57723 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCBP4P57723 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCBP4P57723 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCBP4P57723 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PCBP4P57723 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCBP4P57723 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCBP4P57723 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCBP4P57723 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCBP4P57723 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCBP4P57723 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCBP4P57723 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCBP4P57723 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCBP4P57723 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCBP4P57723 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCBP4P57723 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCBP4P57723 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCBP4P57723 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCBP4P57723 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCBP4P57723 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCBP4P57723 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PCBP4P57723 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCBP4P57723 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCBP4P57723 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCBP4P57723 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCBP4P57723 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCBP4P57723 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCBP4P57723 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCBP4P57723 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCBP4P57723 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCBP4P57723 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCBP4P57723 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCBP4P57723 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCBP4P57723 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCBP4P57723 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCBP4P57723 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCBP4P57723 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCBP4P57723 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCBP4P57723 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCBP4P57723 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCBP4P57723 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PCBP4P57723 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCBP4P57723 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PCBP4P57723 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PCBP4P57723 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCBP4P57723 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCBP4P57723 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCBP4P57723 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCBP4P57723 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCBP4P57723 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCBP4P57723 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PCBP4P57723 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCBP4P57723 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCBP4P57723 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCBP4P57723 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCBP4P57723 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCBP4P57723 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCBP4P57723 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCBP4P57723 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCBP4P57723 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCBP4P57723 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCBP4P57723 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCBP4P57723 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCBP4P57723 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCBP4P57723 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCBP4P57723 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCBP4P57723 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PCBP4P57723 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCBP4P57723 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCBP4P57723 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCBP4P57723 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCBP4P57723 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCBP4P57723 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCBP4P57723 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCBP4P57723 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCBP4P57723 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCBP4P57723 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PCBP4P57723 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PCBP4P57723 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCBP4P57723 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCBP4P57723 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PCBP4P57723 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms