Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSE1LP55060 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSE1LP55060 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSE1LP55060 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSE1LP55060 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSE1LP55060 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSE1LP55060 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSE1LP55060 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSE1LP55060 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSE1LP55060 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSE1LP55060 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSE1LP55060 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSE1LP55060 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSE1LP55060 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSE1LP55060 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSE1LP55060 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSE1LP55060 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSE1LP55060 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSE1LP55060 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSE1LP55060 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSE1LP55060 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CSE1LP55060 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSE1LP55060 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSE1LP55060 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSE1LP55060 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSE1LP55060 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSE1LP55060 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSE1LP55060 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSE1LP55060 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSE1LP55060 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSE1LP55060 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSE1LP55060 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSE1LP55060 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSE1LP55060 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CSE1LP55060 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSE1LP55060 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSE1LP55060 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSE1LP55060 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSE1LP55060 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSE1LP55060 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSE1LP55060 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSE1LP55060 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSE1LP55060 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSE1LP55060 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSE1LP55060 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSE1LP55060 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSE1LP55060 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSE1LP55060 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSE1LP55060 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSE1LP55060 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSE1LP55060 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSE1LP55060 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSE1LP55060 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSE1LP55060 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSE1LP55060 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSE1LP55060 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSE1LP55060 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CSE1LP55060 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSE1LP55060 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSE1LP55060 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSE1LP55060 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSE1LP55060 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSE1LP55060 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CSE1LP55060 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSE1LP55060 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSE1LP55060 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSE1LP55060 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CSE1LP55060 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CSE1LP55060 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSE1LP55060 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSE1LP55060 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSE1LP55060 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSE1LP55060 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSE1LP55060 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSE1LP55060 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSE1LP55060 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CSE1LP55060 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSE1LP55060 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSE1LP55060 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSE1LP55060 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSE1LP55060 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSE1LP55060 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSE1LP55060 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSE1LP55060 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSE1LP55060 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSE1LP55060 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSE1LP55060 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSE1LP55060 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSE1LP55060 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSE1LP55060 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSE1LP55060 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSE1LP55060 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSE1LP55060 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSE1LP55060 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSE1LP55060 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSE1LP55060 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSE1LP55060 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSE1LP55060 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSE1LP55060 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSE1LP55060 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms