Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRX1P54821 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRX1P54821 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRX1P54821 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRX1P54821 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRX1P54821 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX1P54821 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX1P54821 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRX1P54821 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRX1P54821 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRX1P54821 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX1P54821 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX1P54821 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRX1P54821 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRRX1P54821 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRX1P54821 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRX1P54821 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRX1P54821 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRX1P54821 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRX1P54821 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRX1P54821 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRX1P54821 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRX1P54821 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX1P54821 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRX1P54821 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRX1P54821 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX1P54821 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX1P54821 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX1P54821 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRX1P54821 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRX1P54821 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRX1P54821 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX1P54821 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX1P54821 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX1P54821 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX1P54821 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX1P54821 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRX1P54821 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRX1P54821 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRX1P54821 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRRX1P54821 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRRX1P54821 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX1P54821 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX1P54821 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRX1P54821 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRX1P54821 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX1P54821 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRX1P54821 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX1P54821 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms