Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELK3P41970 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELK3P41970 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ELK3P41970 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ELK3P41970 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ELK3P41970 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ELK3P41970 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ELK3P41970 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ELK3P41970 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ELK3P41970 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ELK3P41970 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ELK3P41970 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ELK3P41970 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ELK3P41970 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ELK3P41970 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ELK3P41970 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ELK3P41970 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ELK3P41970 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELK3P41970 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELK3P41970 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELK3P41970 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELK3P41970 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELK3P41970 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELK3P41970 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ELK3P41970 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ELK3P41970 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ELK3P41970 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ELK3P41970 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ELK3P41970 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELK3P41970 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELK3P41970 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELK3P41970 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELK3P41970 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ELK3P41970 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ELK3P41970 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ELK3P41970 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ELK3P41970 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ELK3P41970 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ELK3P41970 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ELK3P41970 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ELK3P41970 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ELK3P41970 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ELK3P41970 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ELK3P41970 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ELK3P41970 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ELK3P41970 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ELK3P41970 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ELK3P41970 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ELK3P41970 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ELK3P41970 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELK3P41970 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELK3P41970 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELK3P41970 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ELK3P41970 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ELK3P41970 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ELK3P41970 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELK3P41970 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELK3P41970 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ELK3P41970 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ELK3P41970 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ELK3P41970 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ELK3P41970 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ELK3P41970 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ELK3P41970 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ELK3P41970 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ELK3P41970 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ELK3P41970 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ELK3P41970 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ELK3P41970 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ELK3P41970 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ELK3P41970 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ELK3P41970 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ELK3P41970 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ELK3P41970 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ELK3P41970 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ELK3P41970 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ELK3P41970 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ELK3P41970 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ELK3P41970 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ELK3P41970 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ELK3P41970 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ELK3P41970 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ELK3P41970 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ELK3P41970 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ELK3P41970 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ELK3P41970 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELK3P41970 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELK3P41970 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ELK3P41970 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELK3P41970 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELK3P41970 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ELK3P41970 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELK3P41970 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELK3P41970 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELK3P41970 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELK3P41970 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELK3P41970 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ELK3P41970 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ELK3P41970 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ELK3P41970 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms